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不得不提的lncRNA芯片

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浏览:- 发布日期:2017-01-20 13:59:44【

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA。lncRNA能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达,参与X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系。lncRNA是非编码RNA研究领域的一个热点。


lncRNA研究通常的策略是通过lncRNA芯片或lncRNA测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行lncRNA表达谱分析;通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA,构建共表达网络,预测lncRNA的靶基因;通过PCR或Northern Blot技术对候选lncRNA验证,确定其表达差异。

 


 

欧易生物作为国内领先的生物技术服务公司,利用Agilent公司专利的SurePrint技术制造,推出的lncRNA芯片已为众多老师的lncRNA研究提供了技术服务。

 


欧易生物lncRNA芯片特点


(1)全面、专业的lncRNA数据库

挖掘权威公共数据库及lncRNA经典研究文献中lncRNA数据。


(2)同时检测lncRNA及mRNA表达差异

包含NCBI RefSeq基因数据库中最新mRNA信息,可在一张芯片上同时对lncRNA和mRNA进行检测,挖掘二者之间的关联。


(3)独特探针设计

独特探针设计及合成,特异性及灵敏度高,检测范围广,能有效区分可变剪切转录本。


(4)特色数据分析服务

与美国研究机构合作开发分析方法,提供全面独特的分析解决方案,并且可以提供与临床结合的分析结果。



 

 

欧易生物的lncRNA芯片目前已经推出了多个版本,随着权威lncRNA公共数据库信息的更新,欧易生物也在不断更新自己的芯片版本。欧易生物的lncRNA人的芯片即将升级到V6.0版本,大鼠和小鼠的LncRNA芯片也将升级到V3.0版本。新版本的芯片将会有哪些提升呢?

 

芯片

物种

格式

探针信息

OE Biotech Human LncRNA   Microarray V5.0

4*180K

lncRNA探针89459条

mRNA探针36206条

OE Biotech Human   LncRNA Microarray V6.0

4*180K

OE Biotech Mouse LncRNA   Microarray V2.0

小鼠

4*180K

lncRNA探针41302条

mRNA探针39430条

OE Biotech Mouse   LncRNA Microarray V3.0

小鼠

4*180K

OE Biotech Rat LncRNA   Microarray V2.0

大鼠

8*60K

lncRNA探针10000条

mRNA探针30367条

OE Biotech Rat   LncRNA Microarray V3.0

大鼠

8*60K

 

据悉,相比前版,新版本芯片中的LncRNA探针将会大幅增加,同时mRNA的探针数也会有明显的提升;此外目前研究比较热门的circRNA也会包含在新款芯片中,也就是说能够在一张芯片中同时检测mRNA、LncRNA和circRNA了,这对同时研究circRNA的老师绝对是个好消息。关于新版本芯片目前只能透露这么多了,具体详情还请持续关注欧易生物官网和微信公众号。

 

 

此外,欧易生物与Affymetrix共同设计完成的

Affymetrix人全转录本lncRNA芯片

是Affymetrix全球首款和企业合作的lncRNA芯片产品,也是唯一一款针对lncRNA全转录本设计的芯片,这款芯片包含27,134条coding基因和63,542条non-coding基因,是Affymetrix所有商业产品中lncRNA信息最全的一款芯片。已有众多的老师利用此款芯片开展了LncRNA的研究。这款芯片也是目前市面上研究LncRNA比较火热的一款芯片。



相信欧易生物的LncRNA芯片一定会给老师们的LncRNA研究提供一臂之力。另外,欧易生物在LncRNA测序以及LncRNA定量等方面也具有完备的技术服务体系,欧易的专业分析队伍也时刻在为老师们提供专业的数据分析服务。

 

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    【本文标签】:lncRNA芯片
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