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当前位置:首页 » 新闻资讯 » 技术&解读&应用 » 微生物多样性16S产品三大升级 | 全覆盖分析、美图、数据挖掘唾手可得

微生物16S多样性产品大升级,数据分析无死角!

阴雨绵绵的五月已然逝去,酷热的仲夏悄然而至!

在这个毕业的季节,广大应届研究生小伙伴们的经历也像极了节气的更替。

然则师兄、师姐皆往矣(即将奔赴各地踏足工作圈),师弟、师妹们心中留下的除了不舍,难免还会疑惑问号吧……

迷惘的少年啊,不用担心,值此端午佳节之际

送给你,从此实验无忧,文章多多啦!

端午将至,喜报频传,欧易生物16S微生物多样性产品也迎来了重磅升级,超低的价格,更优质的服务,必将给你带来非一般的体验!

废话不多说,让我们一起划重点吧!

分析架构调整,行业流行分析全面覆盖

九大分析模块,45项标准分析配置,分析架构即文章写作架构,七个分析学水平,五种常规距离算法,数据分析面面俱到,无死角。

 

结果呈图美化,发表级Figure唾手可得

多项分析结果呈图优化,注重数据展示的同时,兼顾主流SCI期刊配色要求,征服审稿人就是这么简单。

部分合作客户发表文章结果展示

 

新增分析6项,助力数据深度挖掘

Circos 样本与物种关系图

样本与物种共线性关系图是描述样本与物种之间对应关系的可视化圈图,不仅能反映每个样本中优势物种的组成比例,同时也可以展示各优势物种在不同样本中的分布情况。

图片说明:圈图左侧代表物种,右侧代表样本,不同颜色代表不同的分类学门类和样本分组。从左往右看,内圈同一颜色线条的粗细代表该物种在不同样本中的相对丰度;从右往左看,内圈同一颜色线条的粗细代表该样本中不同物种的组成占比。

 

Ternary三元相图

Ternary Plot是用一个等边三角形描述三个变量的不同属性的比率关系,可以直观的展示出不同物种在不同样本(组)中的比重和关系。

图片说明:三角形的3个角分别代表3个不同样本(组),不同颜色的圆点代表不同的分类学门类,圆点的大小代表3个样本(组)中该物种的平均相对丰度,圆点与3个角之间的距离反应该物种在3个样本(组)中的相对丰度大小。

 

相关性corrplot图

Corrplot图可以用圆点的大小和颜色变化来反映二维矩阵或表格中的数据信息,它可以将数据值的大小以定义的圆点大小和颜色深浅进行展示。常用来展示物种与物种或物种与环境因子之间的相关性。

图片说明:红色表示负相关,蓝色表示正相关,颜色越深、圆点越大则表示相关性越强。

 

Indicator分析

指标性物种是指一定区域范围内能指示生长环境或某些环境条件的生物种、属或群落,而Indicator分析常被用来筛选各个样本组中的指标性物种。

图片说明:左侧的柱状图表示不同OTU的丰度信息,右侧的气泡图横坐标表示样本分组信息,气泡的大小表示每个物种在样本组中的indicator值大小,即该物种在该分组中的指示性大小。

 

随机森林分析

随机森林是一个包含多个决策树的集成学习方法,其输出的分类结果是由每棵决策树“投票”产生的结果。由于每棵树在构建过程中都采用了随机变量和随机抽样的方法,因此随机森林的分类结果具有较高的准确度。在微生物多样性的研究中随机森林常被用来筛选潜在的生物标记物(Biomarker)。

图片说明:横坐标为物种重要性衡量标准值,纵坐标为按物种重要性排序后的物种名称。

 

系统发育进化树和物种丰度组合图

在分子进化研究中,通过推断物种间系统发生情况来揭示生物进化过程的顺序,了解生物进化历史和机制。选取某一分类水平上优势物种,利用其代表序列间碱基的差异构建进化树,并结合heatmap直观地展示物种分类关系和丰度信息。

图片说明:左侧表示进化树,不同颜色的树枝表示不同的分类学门类;右侧为heatmap图,图中某一格子的颜色越红表示该物种在对应样本中丰度越高,格子的颜色越绿表示该物种在对应样本中丰度越低。

 

篇幅有限,今天小欧就给大家介绍到这里啦!

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