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2018·欧易生物培训课程

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加权基因共表达网络(WGCNA)

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加权基因共表达网络构建(Weighted Gene Co-Expression Network Analysis, WGCNA)是一种从高通量数据中挖掘模块(module)信息的算法。

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时间/浓度序列趋势分析

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根据基因表达随时间/浓度变化的趋势,利用统计检验手段结合差异倍数寻找在多组样本中具有某种显著性变化趋势的基因集。

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lncRNA高级分析

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基于差异lncRNA,差异gene数据,计算每个lncRNA与gene的pearson相关系数,筛选相关系数0.8以上且p值小于等于0.05的关系对,对这部分gene进行GO,KEGG分析,预测对应lncRNA的功能及可能参与的通路。

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ceRNA分析项目

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GSEA分析

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前 言 单细胞测序技术虽然已有近10年的发展历史了,至今也有接近2000篇文章发表,但与其应用潜力相比,还远远不够。其原因除了认知等方面外,主要是前期的单细胞测序费用昂贵,一个细胞需要数千至上万元,而一个项目至少测上千个细胞。高昂的费用大大限制了其应用。 近年来,随着10× Genomics等单细胞测序技术的发展,大大降低了实验成本,每个细胞的实验费用已经降到了10元左右。另外,分析方法也逐步发展成熟。一个项目投入一二十万,就可能在很短的时间内得到有意义的结果了。 【更多详情】

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