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欧易生物信息分析软件培训班




欧易生物信息软件分析培训班


过往三年,欧易生物的培训班已为400多位生命科学工作者提供了优质的分析软件培训,获得了各方好评。


生物信息学进展日新月异,为了提升培训质量,欧易生物对内容做了优化升级,并分为芯片分析班和测序分析班。初定每月一期。



更好的质量,更前沿的培训内容,小班式优质教学

2017年开始,我们与您相遇在生物信息的海洋



  开班时间

 

2017.07.20 (芯片班)

2017.08.24 (测序班)

2017.09.21 (芯片班)

2017.10.26 (测序班)

2017.11.23 (芯片班)

2017.12.21 (测序班)



  培训内容


芯片



  • 差异基因的筛选:foldchangge计算及t-test;vlookup函数使用;Venn分析

  • 差异基因批量注释:相关网站简介GO 和 KEGG;在线分析工具使用:funnet  DAVID

  • 聚类分析:Mev软件介绍及数据整理;实战操练

  • 网络作图:介绍Cytoscape 软件;实战操练

  • 靶基因预测:Genespring软件预测;在线网站 TargetScan Magia

  • GEO:介绍NCBI GEO数据库;学习检索和提交芯片数据




开班须知:一定携带笔记本电脑并提前安装软件

(以下软件,请根据不同系统,点击下载)


MEV软件安装

Windows 系统软件安装:MeV_4_6_0

苹果系统软件安装:Cytoscape Installer.app

(其他MEV软件链接下载链接:https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/)


cytoscape软件安装

Windows 32位系统软件安装:Cytoscape_3_1_1_windows_32bit

Windows 64位系统软件安装:Cytoscape_3_1_1_windows_64bit

(如果此版本不能安装,请用以下版本)

Windows 64位系统软件安装:Cytoscape_3_4_0_windows_64bit

苹果系统软件安装:MeV_4_8_1

其他cytoscape软件下载链接:http://www.cytoscape.org/download.html


JAVA 软件安装

Windows 32位系统软件安装:jre-7u60-windows-32位电脑

Windows 64位系统软件安装:jre-7u60-windows-64位电脑





测序



上午:

  • NCBI数据库:数据库和常用工具简介

  • 局部比对搜索分析及上机操作:BLAST相关知识点及应用,在线BLAST比对,本地BLAST比对

  • 序列比对软件MEGA:序列导入、编辑和比对,蛋白翻译,系统发育树绘制

  • 答疑与交流

  •  

下午:

  • R语言基础:R数据结构;R数据的输入与输出

  • R语言绘图:散点图绘制;线性回归绘制;物种丰度柱状图绘制;Venn图绘制(在线+R);主成分分析PCA

  • 答疑与交流




开班须知:请一定携带笔记本电脑并提前安装软件

以下软件,请根据不同系统,点击下载


localblast软件安装

           

Windows 32位系统软件安装:ncbi-blast-2.2.30+-win32

Windows 64位系统软件安装:ncbi-blast-2.2.30+-win64.exe

苹果系统软件安装:ncbi-blast-2.2.30+.dmg

其他localblast软件下载链接:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/


MEGA软件安装

          

 Windows 系统软件安装:

MEGA7.0.21_win64_setup 

           苹果系统软件安装:MEGA7.0.21_mac32_setup

其他MEGA软件下载链接:http://www.megasoftware.net/


 


 报名须知



报名时间&方式

每周一至周五 8:30-17:00

通过欧易生物官网在线客服留下姓名+单位+电话+邮箱+线下or线上


每班人数

为保证教学质量,限定12人以内,网络直播间为15个名额


培训费用

 每位老师均免费参加培训班

为保证教学质量,如有老师确定来参加却当天未到则下次参加培训班需缴纳一定费用


开班时间

上午9点半至下午3点半(提供午餐)


开课地点

欧易生物上海总部:上海市闵行区漕河泾浦江高科技园区F区六期(新骏环路138号5幢302)






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