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蛋白质组基因组
蛋白基因组学(Proteogenomics)利用蛋白质组学数据,尤其是高精度的串联质谱数据, 结合基因组和转录组数据对基因组进行解析。蛋白基因组学的解析不仅可以实现对基因组序列的重新注释、发现新基因、校正基因读取错误,还能系统发现蛋白质所具有的信息(如翻译后修饰和信号肽等)。随着高精度串联质谱技术的快速发展,蛋白基因组学已成为功能基因组学研究的重要工具。
技术流程

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技术特征
可以发现大量蛋白所具有的翻译后修饰、信号肽等信息
可以进行新基因的批量发掘以及预测基因的批量校正
覆盖范围广,能在较短时间内对基因组进行多方面深入解析
研究层次高,在所有已进行全基因组测序物种的研究领域中占据重要地位
案例展示
案例一 蓝藻翻译后信息的全蛋白基因组解析
实验材料
不同处理类型尽量丰富的蓝藻样品
研究结论
前沿蓝藻全蛋白基因组分析,鉴定到蓝藻 92.2%的全部预测的编码基因
发现118个新基因
校正了38个预测的基因
大规模鉴定了23种不同的翻译后修饰类型
着重分析发现蛋白修饰在光合系统中起着重要的调控作用
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参考文献
Yang M. et al., Proteogenomic analysis and global discovery of posttranslational modifications in prokaryotes. 2014, PNAS.  


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