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蛋白质组转录组
核酸是生命活动的策划者,决定了生命活动的可能发展方向;蛋白质是生命活动的执行者,决定了生命活动的未来。转录组研究作为核酸研究的重要方向,具有通量高、数据丰富等特点,但由于转录组表达与实际执行功能的蛋白质之间相关性不高等原因,并不能完全准确反映蛋白质的具体功能。蛋白质组技术虽然近几年获得了飞速的发展,但离全蛋白质组检测仍有较大差距。通过对转录组和蛋白组数据的整合实验与分析则可以充分发挥不同组学的研究特点,使得对生物学问题的探究更加可靠。
技术流程

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技术特征
丰富的转录组测序数据有助于未知蛋白特别是未测序物种的未知蛋白的准确鉴定
通过相关性分析等统计分析,可以发现不同转录本的转录后调控作用大小,
为合理使用转录组数据提供有效参考
整合分析时以蛋白水平数据为主,以转录水平数据为辅,
可以在保证结果准确性的同时丰富实验数据,获取更多的生物调控信息
案例展示
案例一  转录组辅助蛋白鉴定
从捕蝇草的消化液的蛋白组成分析猎物消化机制
实验材料
转录组样品:昆虫刺激的叶片
蛋白组样品:人造猎物刺激叶片后的消化液
研究结论
准确鉴定到包括过氧化物酶、核酸酶、磷酸酶、葡聚糖酶、几丁质酶以及多种蛋白酶
多数高表达蛋白被归为病程相关蛋白,推测其消化系统由防御相关的过程演变而来

2

参考文献
Waltraud, X., et al., The protein composition of the digestive fluid from the venus flytrap sheds light on prey digestion mechanisms. 2012, Mol Cell Proteomics.
案例二  转录组与蛋白质组联合分析
野生型和晚熟突变体柑橘的转录组和蛋白质组综合分析增强对果实成熟的认识
实验材料
野生型和晚熟突变体柑橘不同成熟时期的果实
研究结论
发现大量的差异基因属于植物激素通路和细胞壁相关代谢
糖代谢物在果实成熟过程中具有重要作用
许多基因在转录和蛋白水平不一致,表明发生了丰富的转录后调控
揭示在柑橘属成熟过程中的多个成熟相关调控

3

参考文献
Wu, J., et al., An integrative analysis of the transcriptome and proteome of the pulp of a spontaneous late-ripening sweet orange mutant and its wild type improves our understanding of fruit ripening in citrus.2014, J Exp. Bot.


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