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GSEA分析

GSEA分析描述

利用功能注释或实验的结果构建的基因集,将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序,然后检验预先设定的基因集是否在这个排序表的顶端或者底端富集,GSEA方法关注的不是有限几个发生显著改变的差异基因,而是关注这些检测基因的表达在定义的功能分组中是否有共同的表达趋势,是从另一个角度来解读生物学信息,以阐述其中的生物学意义。

前置分析条件

一般仅限于人,其他物种提前咨询。

Demo结果

GSEA分析

Demo结果解读

从上图可以发现,本次得到的结果,Antigen processing and presentation通路相关的基因富集在Group2中,即该通路与表型group2正相关。

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