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当前位置:首页 » 生物信息学分析 » 2018·欧易生物培训课程

欧易生物信息软件分析培训班

过往几年,欧易生物的培训班已为400多位生命科学工作者提供了优质的分析软件培训,获得了各方好评。

生物信息学进展日新月异,为了提升培训质量,欧易生物讲师团队对内容做了优化升级,将课程分为芯片分析班和测序分析班。每月一期(寒暑假除外)。

更好的质量,更前沿的培训内容,小班式优质教学

 2018年,我们将继续与您相遇在生物信息的海洋
 
 

开班时间 

2018.11.09(10X Genomics 培训班) 

 

- 芯片班培训内容 -


芯片基础知识及数据介绍: 关于Affymetrix芯片,Agilent芯片的介绍;
差异基因的筛选:差异倍数及pvlaue计算;excel相关函数在分析过程中的简单实用(如vlookup函数, if函数等);
基因整合分析: Venn分析;
基因功能富集分析:利用DAVID,metascape等网站进行在线的GO,KEGG富集分析;
聚类分析:结合Mev软件绘制聚类图及个性化调整;
网络作图:利用Cytoscape软件对多种关系数据进行网络图绘制(如miRNA-mRNA Network等);
以上分析过程中均包含实战操练

开班须知:请一定携带笔记本电脑并提前安装软件

 软件下载  -


1.MEV软件安装(聚类分析)

 https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/files/mevtm4/MeV%204.9.0/MeV_4_9_0_r2731_win.zip/download

注:MEV在安装好java环境的情况下直接解压即可使用,无须安装。 


2.Cytoscape软件安装(Network

 http://www.cytoscape.org/download.php根据页面提示下载对应的Cytoscap3.6) 
 

3.JAVA 软件安装(jre

 https://java.com/zh_CN/download/ 根据页面提示进行下载安装


 测序班培训内容  - 

上午: 

  1. NCBI数据库:数据库和常用工具简介

  2. 局部比对搜索分析及上机操作:BLAST相关知识点及应用,在线BLAST比对,本地BLAST比对序列比对软件MEGA:序列导入、编辑和比对,蛋白翻译,系统发育树绘制

 答疑与交流


下午:

  1. R语言基础:R数据结构;R数据的输入与输出

  2. R语言绘图:散点图绘制;线性回归绘制;物种丰度柱状图绘制;Venn图绘制(在线+R);主成分分析PCA

答疑与交流 
 

开班须知:请一定携带笔记本电脑并提前安装软件

 


- 软件下载 -


1.localblast软件安装

  

Windows 32位系统软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.2.30/ncbi-blast-2.2.30+-win32.exe


Windows 64位系统软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.2.30/ncbi-blast-2.2.30+-win64.exe


苹果系统软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.5.0/ncbi-blast-2.5.0+.dmg


其他localblast软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/


2.MEGA软件下载http://www.megasoftware.net/


3.demo数据下载
  
 

 - 报名须知 -  

报名时间、方式

 请关注欧易生物微信公众号,后台回复“芯片班报名”,获取报名链接

每班人数

 为保证教学质量,线下实训班限12个名额,网络直播间20个名额 

 培训费用

 免费。为保证教学质量,如有老师报名后,未能参加当天课程,此后报名需缴纳一定费用 

 开班时间

 9:30-15:30(线下实训班提供午餐) 

开课地点 

 欧易生物上海总部:上海市临港浦江科学城新骏环路138号5幢302


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技术热线:021-34781616 咨询热线:4006-4008-26

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