欧易生物

热门搜索关键词:转录组基因组甲基化酵母文库蛋白芯片

021-34781616

联系欧易

服务热线:021-34781616
  • 客服QQ:1019235790
  • 邮箱:market@oebiotech.com
  • 公司地址:上海市闵行区浦江镇新骏环路138号5幢3层

2018-欧易生物信息分析软件培训班


欧易生物信息软件分析培训班


过往几年,欧易生物的培训班已为400多位生命科学工作者提供了优质的分析软件培训,获得了各方好评。

生物信息学进展日新月异,为了提升培训质量,欧易生物对内容做了优化升级,并分为芯片分析班和测序分析班。初定每月一期。

 

更好的质量,更前沿的培训内容,小班式优质教学

 2018年开始,我们与您相遇在生物信息的海洋

 


开班时间 


2018.09.20(芯片班)


 


培训内容

 芯片班培训内容

差异基因的筛选:foldchangge计算及t-testvlookup函数使用;Venn分析

 差异基因批量注释:相关网站简介GO KEGG;在线分析工具使用:funnet  DAVID

 聚类分析:Mev软件介绍及数据整理;实战操练

 网络作图:介绍Cytoscape 软件;实战操练

 靶基因预测:Genespring软件预测;在线网站 TargetScan Magia

 GEO介绍NCBI GEO数据库;学习检索和提交芯片数据


开班须知:请一定携带笔记本电脑并提前安装软件

 软件下载  -


1.MEV软件安装(聚类分析)

 https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/files/mevtm4/MeV%204.9.0/MeV_4_9_0_r2731_win.zip/download

注:MEV在安装好java环境的情况下直接解压即可使用,无须安装。 

 

2.Cytoscape软件安装(Network

 http://www.cytoscape.org/download.php根据页面提示下载对应的Cytoscap3.6


3.JAVA 软件安装(jre

 https://java.com/zh_CN/download/ 根据页面提示进行下载安装


 测序班  -


上午:


  1. NCBI数据库:数据库和常用工具简介

  2. 局部比对搜索分析及上机操作:BLAST相关知识点及应用,在线BLAST比对,本地BLAST比对序列比对软件MEGA:序列导入、编辑和比对,蛋白翻译,系统发育树绘制

 答疑与交流


下午:


  1. R语言基础:R数据结构;R数据的输入与输出

  2. R语言绘图:散点图绘制;线性回归绘制;物种丰度柱状图绘制;Venn图绘制(在线+R);主成分分析PCA

答疑与交流

 

开班须知:请一定携带笔记本电脑并提前安装软件

 


- 软件下载 -


1.localblast软件安装


Windows 32位系统软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.2.30/ncbi-blast-2.2.30+-win32.exe


Windows 64位系统软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.2.30/ncbi-blast-2.2.30+-win64.exe


苹果系统软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.5.0/ncbi-blast-2.5.0+.dmg


其他localblast软件下载:

 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/


2.MEGA软件下载http://www.megasoftware.net/


3.demo数据


 - 报名须知 -


报名时间、方式

 请关注欧易生物微信公众号,进入易动态菜单中填写报名表

每班人数

 为保证教学质量,线下实训班限12个名额,网络直播间20个名额


 培训费用

 免费。为保证教学质量,如有老师报名后当天未来参加课程,下次报名需缴纳一定费用


 开班时间

 9:30-15:30(线下实训班提供午餐)


开课地点 

 欧易生物上海总部:上海市闵行区漕河泾浦江高科技园区F区六期(新骏环路1385302