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0211月
汇总 | 欧易生物 10 月份项目文章汇总
2018 年 10 月,欧易生物用户共有 19 篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:表达谱芯片、lncRNA芯片、转录组测序、外显子捕获测序、简化基因组测序等。详情如下▼ 01 lncRNA调控骨质疏松新机制 Long noncoding RNA Bmncr regulates mesenchymal stem cell fate during skeletal aging 发表...
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3010月
项目文章 | 本月内又一篇 JCI,欧易生物助力老年骨质疏松机制研究
- 前言 - 喜讯不断,欧易生物客户又发 JCI 文章。 前几天才给大家分享了复旦大学王建华教授发表的一篇 JCI 文章,上周欧易客户又一篇 JCI 文章在线发表。让我们一起来看一下文章的主要内容。 基本信息 论文题目:Long noncoding RNA Bmncr regulates mesenchymal stem cell fate during skeletal aging 发表...
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2610月
项目文章 | 欧易客户发现RALF1信号转导中EBP1负向调控作用的分子机制
基本信息 论文题目:EBP1 nuclear accumulation negatively feeds back on FERONIA-mediated RALF1 signaling EBP1的细胞核内积累负向作用于FERONIA调节的RALF1信号转导 发表期刊:PLOS Biology 发表时间:2018.10 影响因子:9.163 作者单位:湖南大学于峰教授 本文涉及的高通量技术:RNA-seq(由上海欧易生物提供服务) 研...
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1510月
文献解读 | 单细胞转录组测序确定小鼠器官生成过程中白三烯通路在调控血液祖细胞形成中的作用
前 言 欧易隆重推出10× Genomics Chromium™单细胞转录组服务后,受到众多科研人员的关注和青睐。今天继续给大家解读一篇10× Genomics单细胞转录组的研究案例,该文章于2018年发表于《Nature Cell Biology》,是单细胞胚胎发育领域的经典文章,并且该文章做了单细胞转录组的后续功能验证工作,因此具有很高...
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1110月
项目文章 | 复旦大学王建华教授等共同发现 HIC1 调控乳腺癌进展新机制
前 言 近日,由复旦大学王建华教授领衔,上海交通大学医学院陆劲松教授、孟祥军教授、侯照远研究员作为共同通讯作者,上海交通大学医学院王莹莹为作者,在 The Journal of Clinical Investigation 期刊发表了有关乳腺癌进展新分子机制。 JCI 影响因子 13.251。下面就带大家一起看一下这篇肿瘤高分文章的详细内容。 研究背...
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0810月
项目文章 | 欧易生物助力复旦大学在植物避荫反应调控机制方面取得新进展
论文题目 Shade-induced nuclear localization of PIF7 is regulated by phosphorylation and 14-3-3 proteins in Arabidopsis 遮荫诱导的拟南芥核定位蛋白PIF7受磷酸化及14-3-3调控 发表期刊:eLife 发表时间:2018.6 影响因子:7.616 作者单位:复旦大学遗传工程国家 重点实验室李琳研究员课题组 本文涉及的高通量技术:酵...
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2909月
全外显子组测序常见问题(下)
11 外显子捕获效率是什么? 外显子测序过程中要用到杂交过程。在人的染色体上有许多与外显子有同源性的部分,这些有同源性的部分很可能在杂交过程中也被捕获下来。所以,测到的序列中,有一部分不是外显子序列。我们把测序得是外显子的部分占全部测序序列的比列称为捕获效率。捕获效率的高低不影响数据质量,只影响数据的有...
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2809月
全外显子组测序常见问题(上)
1 全外显子组测序必须要有参考基因组吗? 必须有,如果没有参考因组,要提供近缘物种的序列,但不能保证捕获结果的可靠性。因为捕获探针是根据提供的参考序列来设计的,如果已知目标区域与参考基因组比有较大出入,例如大片段的插入缺失,是不推荐的。 2 为什么外显子测序在分析时需要跟全基因组比对,而不是直接与目标区域...
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2709月
文献解读 | 全外显子组测序在肿瘤基因突变研究领域的应用
前 言 全外显子组测序主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的基因编码区变异,结合大量公共数据库提供的外显子组数据,有利于更好地解释基因变异和疾病之间的关联及致病机理。特别适合大样本量进行高深度测序,可发现低深度难以发现的基因变异,非常适合肿瘤研究,同时在其他疾病研究领域也应用广泛。 这次,小编整理了...
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2609月
项目文章 | 欧易生物免疫组库测序技术助力肝再生机制研究
前言 今天,小编为大家分享的文章,是由欧易生物与免疫组库研究专家团队经过密切合作,通过高通量测序技术及利用生物信息学方法对高通量测序后的大数据进行分析,成功总结出的疾病模型下免疫组学核心算法。 相关研究成果已发表在Hepatology(IF=14.079)等高影响因子杂志。 基本信息 英文标题:Intrahepatic T cell recepto...
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2509月
全外显子组测序(WES)样品准备指南
背景介绍 全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法,可发现与蛋白质功能变异相关的基因突变。外显子组约占基因组的1-2%,却包含约85%的致病突变。与全基因组测序相比,全外显子组测序检测目标区域明确,更加经济高效,对研究...
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2009月
10× genomics单细胞测序样品准备指南
01 客户预约与上门建库 欧易生物向客户提供10× genomics 上门建库服务,提前两周进行预约即可,老师需尽量自备以下仪器和耗材: 02 样品要求和样品准备原则 1. 样品要求 (1)样品总量:细胞悬浮液,一个样品细胞起始量大于1×105个; (2)样品浓度:5×105-1.2×106/ mL,最低需要1×105/ mL;...
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1909月
项目文章 | 欧易客户发现lnc-C/EBPβ在髓源性抑制细胞中发挥免疫抑制的负调控作用
基本信息 论文题目:Lnc-C/EBPβNegatively Regulates the Suppressive Function of Myeloid-derived Suppressor Cells 发表期刊:Cancer Immunology Research 发表时间(线上):2018.8.31 影响因子:9.188 作者单位:南开大学药物化学生物学国家重点实验室杨荣存教授课题组 本文涉及的高通量技术:基因芯片技术(Agilent ...
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1809月
10× Genomics单细胞测序在免疫组库研究中的应用
免疫组库(immunerepertoire,IR)是指在任何指定时间,某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和。传统的免疫组库研究技术通常是用多重PCR技术或5’RACE扩增决定B细胞受体(BCR)或T细胞受体(TCR)多样性的互补决定区(CDR3区),再结合高通量测序技术实现,但往往只能检测TCR和BCR一条链的序列信息。201...
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1409月
文献解读 | 通过单细胞转录组测序探究ADRB3诱导的脂肪重塑轨迹
摘要 10X Genomics Chromium™ 作为单细胞测序的重要里程碑,已广泛应用于肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测以及胚胎发育等研究。 继上一篇介绍了10X Genomics Chromium™基本原理,今天将为大家解读一篇10X Genomics在干细胞研究中的新案例。 该文章于2018年发表在《Cell Metablisim》,期刊影响因子:...
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1409月
文献解读 | 10× 单细胞转录组测序8月经典文献解读
单细胞测序技术是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术。它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点。单细胞测序相关研究的日益增加,也预示着当前生命科学领域已经逐...
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1309月
Nature | 影响因子40.1,且看m6A与HSPCs的相爱相杀
今日文章 m(6)A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification. 摘要 本文通过对斑马鱼与小鼠的实验分析,揭示了m6A mRNA甲基化修饰在脊椎动物造血干细胞分化中的调控机制 基本信息 材料:斑马鱼胚胎/小鼠 主要技术:MeRIP-seq,RNA-seq,miCLIP–seq,MS 期刊:Nature 影响因子:40.1 什么是m6A?...
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0409月
项目文章 | 微生物多样性在土壤化学修复过程中的响应
细菌16S 高通量测序
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3008月
项目文章 | Plant Cell:CRY1与BES1互作调控BR信号及光形态建成
CRY1和CRY2能够与bHLH转录因子BES1-INTERACTING MYC-LIKE1 (BIM1)相互作用。而BIM能与BRI1-EMS SUPPRESSOR1 (BES1)互作并激活其活性,从而参与BR信号通路。进一步研究发现,CRY1和CRY2特异与去磷酸化的BES1互作。
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0812月
「干货集市」RNA测序数据分析的标准化方法综合评估
干货分享
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