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热门搜索关键词:转录组基因组甲基化酵母文库蛋白芯片

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0812月
「干货集市」RNA测序数据分析的标准化方法综合评估
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0812月
显微切割组织的比较蛋白组分析发现膀胱癌的新分子标志物
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0812月
基于iTRAQ蛋白组学分析揭示Lewy痴呆新皮层调节异常机理
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0812月
通过iTRAQ技术发现特异性胃腺癌分子标志物
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0812月
对多组RNA测序数据的差异表达分析的方法评估
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0812月
「干货集市」Annovar学习笔记
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0812月
「干货集市」转录组建库实验中的那些事儿
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0812月
「干货集市」使用BUSCO评估基因组组装完整性
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0812月
「干货集市」三代基因组组装学习笔记1(文献阅读)
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0611月
山羊的早期皮肤色素沉着过程中LncRNA的表达分析
02.实验材料 以渝东白山羊和酉州黑山羊作为实验材料,取受孕100天的山羊的背部和腹部皮肤做研究。 03.实验方法 1.RNA的抽提及文库构建(去核糖体的方法) 2.测序:Illumina HiSeq 2000 3.数据分析:对测序结果进行生物信息学分析 04.结果分析 1、山羊胚胎皮肤中lncRNA的鉴定及分析 通过测序共得到84.2Gb clean reads,分析...
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0611月
【文献解读】颗粒物暴露与应激激素水平:随机、双盲、空气净化交叉试验
1.基本信息 材料:人血清 主要技术:GC-MS,Uplc-MS全代谢组 期刊:Circulation. 影响因子:19.309 2.文章摘要 暴露于环境颗粒物(PM)会造成不良的健康结果,但潜在的机制在很大程度上是未知的。代谢组学是一个强有力的研究方法,特别在与环境对生命体全代谢组变化影响的研究领域。文章因此对暴露与不同PM程度的大学生血...
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0611月
【易分享】隔着屏幕都让人颤抖的榴莲味,究竟是怎么来的?
喜欢的人欲罢不能,不堪其味的人绕道而行。如果有一种水果配得上如此极端的评价,那就一定非榴莲莫属了。为什么榴莲的气味如此独特?最近,科学家获得了榴莲(Durio zibethinus)的完整基因组测序结果,榴莲拥有独特气味的原因也终于揭晓。这些由新加坡、马来西亚和中国香港科学家报道的榴莲基因组,也让科学家得以鉴别与榴莲...
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0611月
单倍型分析助力六倍体甘薯基因组组装
2.实验方法 甘薯因为其基因组较大(4.4Gb,单套染色体大小在700M到800M之间),而且是六倍体物种(2n=6x=90,B1B1B2B2B2B2),杂合度也较高一直困扰着甘薯基因组研究人员。通过denovo基因组测序共获得~296 Gb 数据,粗略测序深度为67X。 成功组装出六倍体甘薯基因组序列,组装出大小约为836Mb,scaffold N50为201Kb左右,利...
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0611月
转录组测序解释miRNA对牛奶中脂质含量的影响
目前,牛奶已经成为大众最喜爱的饮品之一,素有“白色血液”的美誉。主要营养成份有脂质、蛋白质、乳糖、无机盐等,而其中脂类的成份占到3.5%到4.2%之间。在这些脂质中,有70%的饱和脂肪酸(当过度消耗时不利于身体健康),25%的非饱和脂肪酸(有利于身体健康)和5%的多聚非饱和脂肪酸。有篇文献的研究表明,在牛...
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1710月
【三代测序传】——三代转录组测序应用
在真核生物中,大多数基因都可以通过选择性剪接产生多种转录本,大大提高了基因组的蛋白质编码潜力[1]。来自相同基因的可变剪接产生的不同转录本可能具有显著差异,甚至拮抗作用[2]。短读长的RNA-seq不能跨越转录物的全长,难以整体表征转录本异构体的多样性[3]。 同种型测序(Iso-Seq)可以直接检测转录本的全长,消除了使...
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1710月
【三代测序传】——表观修饰检测
表观遗传修饰影响的生物学过程非常广泛,包括基因表达,宿主-病原体相互作用,环境反应,DNA损伤和修复[1]。表观遗传在继代遗传中也起重要作用。虽然已经鉴定了20多种类型的表观遗传和DNA损伤修饰,但大多数科学家只能使用间接检测方法研究一种类型的胞嘧啶甲基化。直接检测这些变化的能力对于了解DNA修饰对各种自然过程和疾...
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1710月
PPI网络图是什么,竟然比蜘蛛侠的蛛丝网还千丝万缕
PPI是protein-protein interaction的简称,即蛋白质与蛋白质的相互作用,蛋白质间的功能链接通常能够从编码它们的基因间的基因组相关性中推断,而相同功能所需要的一群基因趋向于显示相似的物种覆盖,通常定位在基因组(在原核生物中)上非常邻近的位置,并且趋向于参与基因融合事件。那我们怎么得到基因之间的相互关系呢? 小...
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1710月
ctDNA与肿瘤治疗的那些事
目前对癌症组织进行基因分型仍旧是癌症临床诊断和治疗的依据。然而传统获取癌组织的方式十分繁琐且会给患者带来十分巨大痛苦,导致癌症组织很难获取,这就导致许多肿瘤治疗方式的失效,特别是分子靶向药。 然而ctDNA的出现给现在肿瘤治疗带来了一股清风。就像上面我们提到的,ctDNA主要是肿瘤细胞破裂流出的DNA,并流入血液...
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1710月
【文献解读】转录组分析揭示爪哇香茅次生代谢途径的基因表达差异
实验材料 爪哇香茅,叶子和根部组织均于种植后四个月采摘,每个样本取三个生物学重复。 实验方法 1、RNA的抽提及文库构建(Illumina TruSeq RNA sample preparation v2 kit) 2、测序:MiSeq(叶子)、NextSeq(根部) 3、数据分析:对测序结果进行生物信息学分析 4、差异表达基因的验证 结果分析 1、转录组数据分析显示,共...
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1710月
【三代测序传】——三代测序研究焦点之动植物科学
加快作物、牲畜和工业生物技术研究;真正综合性探索基因组和转录组的遗传多样性。更深入地了解生物学特性背后的遗传学是解决许多农业,工业和环境挑战的关键因素。 SMRT测序提供了大型且高度复杂的植物和动物基因组中遗传多样性的完整视图,Sequel系统在这方面的应用十分广泛,能够为科学家们带来如下能力: 以更高的分辨率...
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