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1912月
技术分享 | 如何快速预测分泌蛋白?一起来Get吧!
分泌蛋白 分泌蛋白是指在细胞内合成后,分泌到细胞外起作用的一类蛋白质。常见的分泌蛋白有:唾液淀粉酶、胃蛋白酶、抗体和部分激素等。 蛋白质分泌是细胞间进行信息传递的重要方式之一。一般的分泌蛋白在其N端都具有信号肽序列,可以通过经典的内质网/高尔基体途径进行运输,并最终分泌到细胞外,被称为经典分泌蛋白;而近...
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1912月
技术分享 | 免疫细胞异质性
前言 Single-cell RNA sequencing to explore immune cell heterogeneity 为了适应环境和抵御外界的威胁,从原核生物到人类都有其强大的免疫系统,且这些免疫系统都分化出了高度特异性(即疾病特异性)的免疫细胞类型,这些细胞一起预防和消除疾病。目前最热门的单细胞技术,对于理解免疫系统如何产生针对许多不同病原...
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1112月
干货分享 | 如何在肺肿瘤微环境中构建基质细胞的表型模型?
前 言 癌旁的基质细胞,如巨噬细胞,T细胞和纤维母细胞,组成了肿瘤的微环境。肿瘤微环境是一个极其复杂的细胞生态系统,但是这些基质细胞的异质性,以及基质和肿瘤细胞之间的相互影响都还没有明确的研究成果。 人们意识到某些基质癌旁细胞也可以作为癌症新的治疗方案的靶点,非小细胞肺癌(NSCLC)患者就可以从此方法中获益...
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1112月
技术分享 | 单细胞RNA测序的实验设计参考
01 背景介绍 目前的转录组测序技术只能获得群体的遗传或表达信息,而无法区分细胞间的差异,单细胞测序技术可以研究单个细胞或基因的表达情况,从而研究细胞异质性,也可以获得基因表达、剪接等信息以及根据这些信息构建的调控关系。因此,在实验之前要进行合理、细致的实验设计,避免一些混杂因素(confounding factors)的...
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0512月
汇总 | 欧易生物 11 月份项目文章汇总
2018 年 11 月,欧易生物用户共有 26 篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:转录组测序、lncRNA 测序、small RNA 测序、表达谱芯片、lncRNA 芯片、miRNA 芯片、微生物多样性测序、简化基因组测序、标记定量蛋白组 iTRAQ、酵母文库等。详情如下▼ 01 Bre1-依赖的 H2B 泛素化通过在...
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0312月
文献解读 | 10× Genomics单细胞转录组测序确定视网膜神经节细胞亚型
前 言 单细胞转录组测序一个非常重要的研究方向就是单细胞分辨率下重新定义细胞类型,挖掘得到新的细胞亚群和marker基因。今天为大家解读一篇单细胞转录组测序在视网膜神经节细胞中的应用案例,该文章通过10 × Genomics单细胞转录组测序获得了六万多个神经节细胞的表达谱,聚类得到了40个神经节细胞亚群,探讨了神经节...
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2911月
文献解读 | 10X Genomics单细胞转录组测序在构建细胞图谱中的应用
前 言 前期,我们已经为大家介绍了10X Genomics 单细胞转录组测序在肿瘤异质性、干细胞分化以及胚胎发育中的案例解析。除了以上这些研究方向,10X Genomics单细胞转录组测序最直接的应用就是单细胞水平上重新定义细胞类型,构建细胞图谱。 本次将为大家带来三篇单细胞图谱类型的文献案例,分别为: 构建乳腺癌微环境中免疫...
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2911月
汇总 | 欧易生物 8月项目文章汇总
欧易生物08月项目文章汇总2018 年 8 月,欧易生物用户共有 27 篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:表达谱芯片、lncRNA 芯片、miRNA 芯片、转录组测序、circRNA 测序、small RNA 测序、微生物多样性测序、蛋白组、代谢组、酵母文库等。
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2711月
项目文章 | SCIENCE子刊:茉莉酮酸调控青蒿素合成机制
基本信息 论文题目:Jasmonate promotes artemisinin biosynthesis by activating the TCP14-ORA complex inArtemisia annua 发表期刊:SCIENCE ADVANCES 发表时间:2018.11 影响因子:11.511 作者单位:上海交通大学唐克轩教授课题组 本文涉及的高通量技术:酵母双杂交文库(由欧易生物提供服务) 研究背景 青蒿素及其衍生...
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2611月
汇总 | 欧易生物 9 月项目文章汇总
2018 年 9 月,欧易生物用户共有 14 篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:转录组测序、circRNA 测序、lncRNA 芯片、miRNA 芯片、代谢组等。
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2011月
项目文章 | 欧易客户通过miRNA芯片技术发现外泌体途径诱导上皮性卵巢癌发展的作用机制
基本信息 论文题目:Exosomes released from tumor-associated macrophages transfer miRNAs that induce a Treg/Th17 cell imbalance in epithelial ovarian cancer 发表期刊:Cancer Immunology Research 发表时间:2018.11 影响因子:9.188 通讯作者:上海交大医学院 汪希鹏教授、林盈盈博士 本文涉及的高通量技术:安捷
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1911月
重磅升级 | lncRNA 芯片全面升级
前言 长链非编码 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过 200 nt 、不编码蛋白的 RNA 。 lncRNA 能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达。 lncRNA 芯片可以快速、高效地筛选出与疾病或特定表型相关的差异 lncRNA ,为人类疾病的发生、发展和防治提供理论依据。 欧易生物从探针设计、数据挖掘等各个...
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0211月
汇总 | 欧易生物 10 月份项目文章汇总
2018 年 10 月,欧易生物用户共有 19 篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:表达谱芯片、lncRNA芯片、转录组测序、外显子捕获测序、简化基因组测序等。详情如下▼ 01 lncRNA调控骨质疏松新机制 Long noncoding RNA Bmncr regulates mesenchymal stem cell fate during skeletal aging 发表...
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3010月
项目文章 | 本月内又一篇 JCI,欧易生物助力老年骨质疏松机制研究
- 前言 - 喜讯不断,欧易生物客户又发 JCI 文章。 前几天才给大家分享了复旦大学王建华教授发表的一篇 JCI 文章,上周欧易客户又一篇 JCI 文章在线发表。让我们一起来看一下文章的主要内容。 基本信息 论文题目:Long noncoding RNA Bmncr regulates mesenchymal stem cell fate during skeletal aging 发表...
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2610月
项目文章 | 欧易客户发现RALF1信号转导中EBP1负向调控作用的分子机制
基本信息 论文题目:EBP1 nuclear accumulation negatively feeds back on FERONIA-mediated RALF1 signaling EBP1的细胞核内积累负向作用于FERONIA调节的RALF1信号转导 发表期刊:PLOS Biology 发表时间:2018.10 影响因子:9.163 作者单位:湖南大学于峰教授 本文涉及的高通量技术:RNA-seq(由上海欧易生物提供服务) 研...
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2510月
项目文章 | 欧易客户发现肝损伤程度决定肝细胞命运
今天给大家介绍另一篇转录组测序的客户文章。 文章由第二军医大学何志颖教授课题组5月14日发表于《Cell Death Disease》,杂志影响因子5.965。该文章主要报道了肝细胞衰老可以通过激活免疫监视抑制癌变,肝的损伤程度决定了肝细胞的命运,即走向衰老或者癌变。 文章中转录组测序实验和分析工作由欧易生物完成。下面,带大家...
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1510月
文献解读 | 单细胞转录组测序确定小鼠器官生成过程中白三烯通路在调控血液祖细胞形成中的作用
前 言 欧易隆重推出10× Genomics Chromium™单细胞转录组服务后,受到众多科研人员的关注和青睐。今天继续给大家解读一篇10× Genomics单细胞转录组的研究案例,该文章于2018年发表于《Nature Cell Biology》,是单细胞胚胎发育领域的经典文章,并且该文章做了单细胞转录组的后续功能验证工作,因此具有很高...
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1110月
项目文章 | 复旦大学王建华教授等共同发现 HIC1 调控乳腺癌进展新机制
前 言 近日,由复旦大学王建华教授领衔,上海交通大学医学院陆劲松教授、孟祥军教授、侯照远研究员作为共同通讯作者,上海交通大学医学院王莹莹为作者,在 The Journal of Clinical Investigation 期刊发表了有关乳腺癌进展新分子机制。 JCI 影响因子 13.251。下面就带大家一起看一下这篇肿瘤高分文章的详细内容。 研究背...
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0810月
项目文章 | 欧易生物助力复旦大学在植物避荫反应调控机制方面取得新进展
论文题目 Shade-induced nuclear localization of PIF7 is regulated by phosphorylation and 14-3-3 proteins in Arabidopsis 遮荫诱导的拟南芥核定位蛋白PIF7受磷酸化及14-3-3调控 发表期刊:eLife 发表时间:2018.6 影响因子:7.616 作者单位:复旦大学遗传工程国家 重点实验室李琳研究员课题组 本文涉及的高通量技术:酵...
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2909月
全外显子组测序常见问题(下)
11 外显子捕获效率是什么? 外显子测序过程中要用到杂交过程。在人的染色体上有许多与外显子有同源性的部分,这些有同源性的部分很可能在杂交过程中也被捕获下来。所以,测到的序列中,有一部分不是外显子序列。我们把测序得是外显子的部分占全部测序序列的比列称为捕获效率。捕获效率的高低不影响数据质量,只影响数据的有...
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