欧易生物

热门搜索关键词:转录组基因组甲基化酵母文库蛋白芯片

021-34781616

当前位置: 首页 » 新闻资讯 » 技术&解读&应用
1109月
测序儿女多奇志,不爱红妆爱组装
在信息科技欠发达的早期,科学家们发明了引物步移技术,以上一段读长末尾已知序列为参考,设计下一段测序引物,通过步步为营的方式获得整段序列。为了提高工作效率,生物领域的科研工作者们采用了类似计算机领域的分治法思想,将整个基因组分割成多个小的片段,分别测序这些片段后,再将已知片段拼接。 分割的方式有多种,有...
阅读详情>
1109月
【三代测序传】——靶向捕获方面的更多应用
人HLA鉴定 项目规模灵活(例如通过外显子2、3和/或4、或者整个HLA基因的相位进行调整); HLA基因SNP差异区域具有等位基因特异性的多态性; 实现无插补等位基因分离; 检测5’UTR,内含子和3’UTR内调节区的变异; 充分表征多克隆样品中的微小变异,如癌症或转录物; 无需参考基因组,可获得新的...
阅读详情>
1109月
重磅:2017年自然指数正式出炉!
8月31日,英国自然出版集团正式更新了2017年自然指数(统计时间节点为2016.1.1至 2016.12.31)。中国内地共有71家科研机构位列全球前500位,其中内地高校46所。 2014年11月,自然出版集团首次以全新的“加权分值计数法”(WFC,weighted fractional count)指数方式发布了全球“自然指数”。自然指数的...
阅读详情>
1109月
高冷的科学数据也能如此优美的展示 – Circos简介
Martin Krzywinski 最早开发了Circos,他不仅是一名生物信息科学家,同时也是一位优秀的专业摄影师。科学与艺术的双重造诣使得 Circos 不仅具备完善的数据可视化功能,优美的展示方式也是Circos的一大特色。 强大的功能,丰富展示方式虽是Circos相较于其他软件的优点,但也它的缺点,因为这使它比其他软件更难于上手。另外,...
阅读详情>
1109月
【三代测序传】——复杂种群研究
鉴定病毒种群 具有独特单倍体混合物的去卷积; 跟踪病毒种群的进化和系统发育; 鉴定和量化微小的变异; 完整装配大型病毒基因组。 病毒存在于每个个体的复杂混合物中,并且对该群体内每种病毒变体的分辨能力对于了解进化、耐药性突变的发展和免疫逃逸至关重要。鉴于共存的分离物可能只会通...
阅读详情>
1109月
扩增子测序简介
概述扩增子测序是一种高靶向性方法,用于分析特定基因组区域中的基因变异。PCR产品(扩增子)的超深度测序可以有效地识别变异并对其进行特征分析。总体思路是靶向地捕获目标区域,然后进行新一代测序(NGS),分析测序结果,得到相应信息。 扩增子测序主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等。采...
阅读详情>
2808月
【三代测序传】——人生物医学研究中的捕获测序
在整个基因上有明确的相位多态性(序列/片段组装清晰); 通过STR和基因内的其他低复杂度区域进行序列分析; 检测常见的或新的结构变异,并精确定位断点(Breakpoint); 完全表征多克隆样品中的微小变异。 有针对性的测序通过将数据收集集中在最相关的基因组区域以优化资源利用,但是如果没有捕获到您需要的信息,...
阅读详情>
2808月
大神教你零基础绘制3D动态Network图
还在为Cytoscape网络图的绘制心塞吗?还在因为关系对太多调图烦恼么?是否觉得2D网络互作图不够炫酷?读书少了吧,读书少了该好好听讲!下面请听大圣为大家开讲。 您只需要一台电脑,可Windows也可Linux,然后只要您安装了R软件即可。(不会安装R?没关系,欧易每月一次的小语言培训班火热报名中,名额有限,各位老师们快快...
阅读详情>
2808月
【三代测序传】——动植物研究中的捕获测序
有效地复用大型扩增子以快速筛选和鉴定变异; 发现用于改良多倍体育种的单倍型特异性标记; 准确重新组装整个基因区域(几M大小)进行基因连锁研究; 确认转基因插入位点并验证基因编辑事件; 研究含有相关信息的区域来确定进化或驯化历史; 捕获不同大小的完整基因,便于基因调查中进行灵活高效的实验设计。...
阅读详情>
2808月
早期非小细胞肺癌的cfDNA突变检测
在文献解读之前,首先来科普几个概念。 cfDNA: cell free DNA的缩写,指游离于细胞外的DNA。对于健康的人来说,血液中的cfDNA主要来源是体细胞正常的新陈代谢,应该维持在一个较低的水平。当有严重的系统性器官损伤(肿瘤形成)时,血液中的cf DNA含量增加,甚至在肿瘤形成早期即可以被检测出来,这对于临床检测具有重要意义...
阅读详情>
2808月
【三代测序传】——微生物学和传染病研究中的捕获测序
解决病毒或宏基因组样本中的复杂群体; 确定多重插入噬菌体元件的顺序和方向; 目标区域在宿主生物体内——研究病毒整合和整合位点; 整个目标区域内的相位变化; 进行复合多轨迹序列分型(Multiplexedmulti-Locus Sequence Typing,MLST)。 靶向测序可以让您专注于微生物基因组中的特定区域,减少研...
阅读详情>
2108月
【三代测序传】——微生物全基因组SMRT测序
获得金标准的参考基因组数据; 重建完整的基因和基因簇; 阐明可移动成分在耐药和传播中的作用; 评估DNA修饰对发病机制的影响。 尽管二代测序已经极大减少了微生物基因组测序的成本,但由于二代测序本身的一些技术瓶颈,这方面我们获得的数据一般只能绘制微生物基因组草图,不够精确;另外基因组拼接的问题也挑战...
阅读详情>
2108月
我和生物信息
在他屁股后追了好久,本文作者才在不胜烦扰下答应小编分享自己的感悟和思考。小编曾在他的博客下浏览过,三四百篇生信运行和学习过程中整理的笔记和小结,实用且简练,积少成多,令人惊讶和叹服。从数学专业转到生信行业近十年,平常比较深沉和规律,他说他只会写编程,不会写文章。我说没关系,想到什么写什么就好。下面就...
阅读详情>
2108月
全基因组甲基化测序技术简析
DNA 甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式。近年来,大量研究表明DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生,起着至关重要的作用。 那DNA甲基化有什么特点,就目前来说脊椎动物DNA 甲基化的模式不同于细菌,在细菌体内胞嘧啶和胸腺嘧啶都可以发生甲基化,而脊椎动物只有5...
阅读详情>
2108月
NIH基金信息查询
我们在有些文献中会发现这样的Grant support信息: 我们只需要红线部分的信息就可以进行查找了。 NIH基金的官方查询网址是:https://projectreporter.nih.gov/ 打开后界面如下: 我们找到红框圈住的地方,按照示例输入刚才我们红线标注的Grant信息: 然后点击: 之后会出现如下界面: 看到这样的提示不用着急,我们点击...
阅读详情>
1108月
【三代测序传】——应用概述
三代基因组测序 全基因组测序 从整体上以单碱基对分辨率检测结构变异。 更高质的人类基因组全新组装; 生成高品质的植物、动物基因组; 同时检测表观遗传信息; 在单次实验中进行完整的微生物基因组测序; 靶向捕获测序 表征人类遗传疾病的复杂区域; 对植物和动物进行候选基因或驯化研究; ...
阅读详情>
1108月
人全基因组SMRT测序
人类遗传学领域的核心是遗传变异研究。越来越多的人意识到,SNVs不能描述人类遗传变异的全部故事,结构变化可能是健康和疾病易感性的重要驱动因素[1]。事实上,人类基因组中的变异大多产生在结构变异中[2]。变异的发现与测序技术和计算算法的发展紧密相连,由于人类遗传变异的复杂性和测序技术的偏差,多年来建立“黄金...
阅读详情>
1108月
多数生命科学行业的研究生似乎处于一个尴尬的境地
绝大多数生命科学行业的研究生似乎处于一个尴尬的境地。 他们的思想保持着较高水准的独立, 他们的精神有一定程度的洁癖, 由于从事的就是研究领域的工作, 对事物的认知是辩证的,理性的, 并且在说话与叙事时逻辑清晰论点明确刻意且有攻击性。 这样看起来,似乎没什么毛病, 实打实具备人才的标准,又有学历又有深度。 ...
阅读详情>
1108月
通过韩春雨事件回顾基因江湖
远去的江湖 脱氧核糖核酸作为物理存在,其序列会因为各种反应而改变。 穆勒在1927年《科学》杂志发表文章《基因的人工诱变》,发现X射线能够诱发果蝇基因突变及染色体异常,这篇文章的后续研究产生了大量的人工诱变个体,穆勒也因此获得了1946年的诺贝尔生理学或医学奖。1 1979年,拉塞尔等人在《美国科学院院报》发表文章声...
阅读详情>
1108月
Trinity——无参转录组一条龙服务
Trinity,很多行内人都认识它,不知不觉中,它已经成为了无参转录组组装的代名词。 你用了Trinity,而你还在为后续分析,辛辛苦苦的敲键盘吗?那你可就out了! 今天就让小编来给你补补Trinity: 1、评估Trinity组装结果,并计算raw count、FPKM: run_RSEM_align_n_estimate.pl eg: $TRINITY_HOME/util/RSEM_util/run_RSEM...
阅读详情>
记录总数:396 | 页数:20 首页 上一页 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...> 下一页 尾页

联系欧易

服务热线:021-34781616
  • 客服QQ:1019235790
  • 邮箱:market@oebiotech.com
  • 公司地址:上海市闵行区浦江镇新骏环路138号5幢3层