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2203月
大事件!10X Genomics开启植物单细胞研究新纪元!
- 前 言 - 近年来,随着10X Genomics等单细胞平台技术的逐渐成熟,单细胞测序在医学相关领域的应用得到迅速发展。在Cell、Nature和Science等顶级期刊上,每个月都会有单细胞测序相关的研究文章发表。但在植物研究领域,受样本取材的限制和植物“异质性”的不足,植物单细胞测序的文章鲜有发表。 2月份,Pla...
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2203月
单细胞ATAC-seq应用解析
前言 单细胞测序是近年来最热门的技术之一。其中单细胞ATAC-seq就是从单细胞水平上研究染色质开放性,主要用于转录调控序列的检测,结合单细胞RNA-seq,便可以分析出基因组中所有活跃转录的调控序列。该技术已经被广泛应用于多个研究领域,例如: 肿瘤异质性研究、基因调控网络分析、细胞谱系示踪、生物标记物发现等。 首先...
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2203月
中南大学湘雅医院罗湘杭课题组:骨髓间充质干细胞来源的外泌体miRNA调节衰老相关的胰岛素抗性
?? 胰岛素抗性是老年人群中发生II型糖尿病的主要病理特征,然而与衰老相关的胰岛素抗性的深层机制仍不清楚。在这项发表于ACS Nano杂志(IF 13.709)上的一项研究中,中南大学湘雅医院内分泌科罗湘杭课题组的研究人员发现骨髓间充质干细胞分泌外泌体中的miR-29b-3p调节着衰老相关胰岛素抗性,可能将会是治疗衰老相关胰岛素抗...
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0703月
项目文章 | 欧易客户发现甘草酸可通过调节肠道菌群阻止高脂饮食促进的转移
基本信息 论文题目:Modulation of intestinal microbiota by glycyrrhizic acid prevents high-fat diet-enhanced pre-metastatic niche formation and metastasis 发表期刊:Mucosal Immunology 影响因子:7.360 作者单位:武汉大学 本文中所涉及的微生物多样性测序由欧易生物提供服务 研究背景 肥胖是乳腺癌、晚期恶性黑...
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0703月
单细胞ATAC-seq:道理能说千千万,不如落实真拼干
若干年后,人们在讨论单细胞ATAC-seq时,2018年一定是不容忽视的一个年份。 根据Web of Science统计数据,2018一年ATAC-seq文章发表数目骤增至26篇,几乎达到前些年文章数目的总和。 另外一个重要的评价因素是, 10X Genomics于2018年年底正式推出了第一个商业单细胞ATAC-seq产品及实施方案。 在过去的一段时间内,关于...
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0403月
汇总 | 欧易生物 2 月份项目文章汇总
2019 年 2 月,欧易生物用户共有 18 篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:表达谱芯片、lncRNA 芯片、miRNA 芯片、转录组测序、全转录组测序、lncRNA 测序、微生物多样性测序等。详情如下▼ 01 甘草酸调节肠道微生物菌群可以预防高脂饮食增强的转移前微环境形成和转移 Modulation of intes...
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0103月
酵母双杂交应用解析
蛋白与蛋白互作的研究方法中,酵母双杂交体系是很受欢迎的。但是在实验完成后怎样进行数据整理,使文章结构更完整。今天小编结合一篇发表于Plant Physiology上的文章(文末有链接),带大家梳理一下。 首先是,当实验做完数据统计发现内容不够怎么办?在蛋白选择上,有木有做到以下几点。 如果你只有一个诱饵蛋白,做完筛选...
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2802月
项目文章 | 蛋白代谢技术助力客户一区期刊发文
前 言 今天分享给大家一篇,运用了鹿明生物GC-MS代谢组和蛋白iTRAQ技术的客户文章,该文由南京大学赵丽娟老师发表在EST(Environmental Science Technology)杂志。 基本信息 文章题目:C60 Fullerols Enhance Copper Toxicity and Alter the Leaf Metaboliteand Protein Profile in Cucumber C60富勒醇对铜协迫黄瓜叶片组...
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2702月
全外显子组测序在肿瘤免疫治疗和耐药研究领域的应用
- 前 言 - 全外显子组测序(whole exon sequencing,WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法,主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的基因编码区变异,结合临床相关资料,可以更好地解释基因变异和疾病之间的关联及致病机理。 接下来,小编就为大家介绍几个全外显...
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2702月
汇总 | 欧易生物 1 月份项目文章汇总
2019 年 1 月,欧易生物用户共有 18 篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:表达谱芯片、lncRNA 芯片、miRNA 芯片、甲基化芯片、全转录组测序、circRNA 测序、small RNA 测序、微生物多样性测序等。详情如下▼ 01 头颈癌中肿瘤成纤维细胞外泌体 miR-196a 通过靶向 CDKN1B 和 ING5 产生顺铂耐...
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2702月
项目文章 | ceRNA 高分文章套路拿去,不谢
前 言 ceRNA (Competing endogenous RNA, 内源竞争性 RNA),通常指 mRNA、lncRNA、circRNA 等 RNA 分子,竞争性结合 miRNA 的作用方式。当 miRNA 被 lncRNA 或 circRNA 竞争性结合时,受 miRNA 调控的 mRNA 转录水平会上升。 那么 ceRNA 研究应该如何开展? 2019 年 1 月 7 日,同济大学附属第十人民医院张春林教授课题组,...
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2602月
项目文章 | 上海九院发现头颈癌化疗耐药中外泌体 miRNA 作用机制
基本信息 论文题目:Exosomal miR-196a derived from cancer-associated fibroblasts confers cisplatin resistance in head and neck cancer through targeting CDKN1B and ING5 发表期刊:Genome Biology 发表时间:2019.1.14 影响因子:13.214 本文第一作者为上海交通大学医学院附属第九
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2901月
单细胞和TCR测序揭示了调节性T细胞的表型图谱
前言 CD4+调节性T细胞(Treg)在保持体内免疫平衡中起关键作用,他们的表型异质性反映了环境多样性以及它们所调节的靶细胞的多样性。因此,本文以小鼠的淋巴组织和人血为材料,用单细胞转录组、激活检测和TCR分析来探究调节性T细胞和传统的CD4+FoxP3-T细胞(Tconv)的表达谱。 实验方法 1、实验材料:小鼠、人-血 2、single...
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2801月
单细胞测序技术分享 | T淋巴细胞白血病
前 言 T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)是一种儿童中常见的恶性肿瘤,由于未成熟的T细胞克隆增殖导致。随着测序技术的不断发展,NGS技术提供了与T-ALL发病机制相关的各种基因组损伤/病变的详细概述。研究发现,在T-ALL中,CDKN2A/2B和NOTCH1是最容易受到影响的基因。此外,在诊断中发现T-ALL细胞中有10到20个蛋白质改变的...
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2801月
干货分享 | 10X Genomics单细胞ATAC-seq技术简介
前 言 18年年末,10X Genomics正式推出了单细胞ATAC-seq产品及实施方案,这是目前第一个成熟的单细胞表观基因组特征的商业化解决方案,为探索细胞发育的机理机制、深入了解疾病的诊断和治疗提供便利。 01 ATAC-seq技术 ATAC-seq(染色质开放性测序技术, Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是通...
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2801月
项目文章 | 欧易生物助力血清保护机体免受TBI诱导的造血损伤机制研究
基本信息 论文题目:Mouse serum protects against total body irradiation-induced hematopoietic injury by improving the systemic environment after radiation 发表期刊: Free Radical Biology and Medicine 发表时间:2018.12.17 影响因子:6.020 作者单位:中国医学科学院放射医学研究所樊赛军教授课题组
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2401月
一文看完欧易生物客户 2018 年 SCI 文章
欧易生物的项目文章我们进行了分月汇总,现在一年过去了,再就全年的项目文章进行一次总览。 2018 年,欧易生物用户可谓是成果丰硕,共发表 SCI 文章 196 篇,平均 IF 4.113。 按照文章影响因子来看:IF 10 共6 篇,其中最高为 21.506 (Nature Immunology);7 IF 10 共 6 篇;5 IF 7 共 27 篇;3 IF 5 共 88 篇;IF ...
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2401月
单细胞测序技术分享 | 乳腺癌细胞多样性
Profiling human breast epithelial cells using single cell RNA sequencing identifies cell diversity 前 言 乳腺癌是一种具有高度异质性的疾病,由发生基因改变的乳腺上皮细胞引起。虽然已经鉴定出了几种不同的上皮细胞亚群,但目前对人类乳腺的异质性和分化层次仍未完全理解。了解乳腺癌在其早期阶段的起源有可能促进癌...
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2301月
汇总 | 欧易生物 12 月份项目文章汇总
2018 年 12 月,欧易生物用户共有20篇文章发表,涉及多个研究方向,其中应用到的欧易生物技术服务产品包括:lncRNA 芯片、miRNA 芯片、微生物多样性测序、简化基因组测序、外显子捕获测序等。详情如下▼ 01 小鼠血清通过改善辐射后的全身环境来防止全身照射诱导的造血系统损伤 Mouse serum protects against total body ir...
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1912月
技术分享 | 如何快速预测分泌蛋白?一起来Get吧!
分泌蛋白 分泌蛋白是指在细胞内合成后,分泌到细胞外起作用的一类蛋白质。常见的分泌蛋白有:唾液淀粉酶、胃蛋白酶、抗体和部分激素等。 蛋白质分泌是细胞间进行信息传递的重要方式之一。一般的分泌蛋白在其N端都具有信号肽序列,可以通过经典的内质网/高尔基体途径进行运输,并最终分泌到细胞外,被称为经典分泌蛋白;而近...
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