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PE样本CNV---经济实用的OncoScan CNV FFPE 芯片

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浏览:- 发布日期:2016-12-09 08:42:07【

欧易生物为老师提供美国著名芯片公司的Affymertix Oncoscan FFPE系列芯片技术服务----

----该芯片利用分子倒置探针技术(MIP),是一种分析拷贝数变化,杂合性缺失,检测获得性突变的成熟技术,MIP 可以用来捕获超过220000个 SNP 的等位基因,这些 SNP 位于精心选择的基因组位点,均匀分布在整个基因组内,且在约900个癌基因中分布的密度增高。

最高探针密度覆盖的基因是通过与 stand up to cancer 癌症联盟(SU2C)的顶尖科学家合作共同选择,其他目标基因按照癌症基因组协会的名单和 Wellcome Trust Sanger 研究院的癌症基因统计表选择。MIP 探针经过设计,可以检测有着最高次要等位基因频率(MAF)的 SNP,同时经过选择,可获得因拷贝数变化而引起的等位基因不平衡的信息。

拷贝数变异(CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1 kb 以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV 是基因组结构变异 ( SV ) 的重要组成部分。CNV 位点的突变率远高于SNP,是人类疾病的重要致病因素之一。大量研究表明,尤其是肿瘤,与拷贝数变异密切先关。

实体瘤拷贝数分析对于癌症诊断,预后,治疗预防选择重要性日益提升。而研究中,FFPE 样本由于容易存储而占绝大多数,但是往往被限制在 FFPE 样本存在高度降解,获得 DNA 数量有限等问题上。

这里为老师推荐一款新产品:OncoScan CNV FFPE 芯片

这款新产品 OncoScan CNV FFPE 芯片减少了 OncoScanFFPE 芯片中74个突变位点的检测,其余设计和 OncoScanFFPE kit 完全一致,价格经济的同时完全能够满足转化医学和临床诊断的对CNV检测需求,经济实惠!

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    【本文标签】:CNV 芯片 SNP 拷贝变异数
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