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一个实用的生物小软件——BioXM

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浏览:- 发布日期:2017-08-02 09:35:05【

在我们的科研生涯中不免会用到不少的生物软件,比如Primer Premier 5,DNAMAN。今天小编介绍一款实用的小软件,它就是BioXM,目前能找到的版本是2.6版的。

其软件界面如下:

接下来我们就来聊聊它能做什么。

1、多序列比对

我们在序列0和序列1中输入两个序列,如下图:

之后我们点击左边的序列比对按钮,选择DNA比对,并选择右边框内的两个序列。之后点击确定,就能出比对的结果,这两个序列有一处是不同的。

可以看出它能方便的寻找到两条序列的差异处。当然这也能用来比对氨基酸序列。

2、酶切位点分析

我们在任意的序列输入框中输入要分析的序列,点击左边的酶切位点分析按钮,会出现下面的结果,并且在结果的最下方还会列出序列中没有发现的常见酶,是不是很贴心。

3、氨基酸序列转化

有时候我们在网上查到的氨基酸序列是简写的单字母序列,但是文章中由要求全部写成三字母的序列,这时候我们在序列输入框中输入氨基酸序列,点击工具,氨基酸单字母表示转化为3字母。选择好你需要的参数点击确定,就会出现下图,是不是很方便。

4、引物信息分析

我们合成了引物有时候弄没了引物的一些信息,比如TM值或是应该加多少水溶解。这时候我们可以点击引物分析,引物浓度与TM值计算,在并在输入框中输入你的引物序列,点击计算,就会显示该引物的TM值,GC含量,分子量,以及加水量,是一个非常实用的小功能。

以上这些功能相信大家在日常科研中总会用到,其实它还有别的小功能,有兴趣的人可以自己去研究,比如它还有一个久坐提醒功能,如下图,是不是很贴心。相信这个软件一定能在你需要的时候帮助你。


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