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与肾透明细胞癌转移相关的lncRNA

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浏览:- 发布日期:2016-10-17 09:48:57【

【前言】

文章的通讯作者单位为新疆医科大学附属肿瘤医院。

【研究背景】

肾细胞癌(RCC)是泌尿系统中恶性度较高的肿瘤,也是最常见的肿瘤之一,占成人恶性肿瘤的3%,每年估计新增150000新病例,近115000人死亡。在肾肿瘤中,肾透明细胞(RCCC)是最普遍的亚型。基础研究已经表明遗传在RCCC发展过程中起到了重要的作用,但是lncRNA在肾透明细胞癌(RCCC)肿瘤形成过程中的作用仍是未知的。

【研究内容】

1. 样本来源:90个患者的肿瘤样本和非肿瘤组织,患者经病理实验证实是RCCC且没有接受放化疗治疗,具体样本信息如下:

2. 使用lncRNA芯片- Human lncRNA expression microarray (4X180K,Agilent)检测基因和lncRNA的表达差异。在两组间检测到3862个差异表达的lncRNA,其中1619个lncRNA表达上调,2243个lncRNA表达下调;2935 mRNA表达差异,其中1375 mRNA表达上调,1560 mRNA表达下调。

3. 选择6个差异表达的lncRNA使用RT-PCR验证,验证结果与测序结果一致。

4. 通过共表达分析发现109 lncRNAs和532 coding genes有共表达关系,其中451 pairs正相关,120pairs负相关。通过lncRNA-TF-mRNA共表达网络分析发现,NF-kB1在信号通路中是重要的调控因子。

5. 通过进一步的相关性分析,发现NONHSAT123350与RCC转移显著相关(r=0.92)。

6. 选择NONHSAT123350进行生存曲线分析。

【研究结论】

研究结果表明,lncRNA表达异常与肾癌形成相关,NONHSAT123350与RCCC转移显著相关,可以作为一个潜在的治疗靶点。

【文献原文】

Liu H, Chen P, Jiang C, etal. Screening for the Key lncRNA Targets Associated With Metastasis ofRenal Clear Cell Carcinoma. Medicine(Baltimore), 2016, 95(2): e2507. (IF: 5.723)

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    【本文标签】:lncRNA 神透明细胞 RCCC 癌转移
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