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Ensembl biomart工具简介

2016-11-03 09:35:53 

Ensembl(ensembl.org)网站是常用的物种参考基因组来源之一,网站提供的biomart工具可以对物种的基因进行功能注释,以及跨数据库注释。

以下介绍使用的操作步骤:

1.打开http://asia.ensembl.org/biomart/martview网址

然后使用下拉框-CHOOSE DATABASE- 选择数据库,对应基因进行注释我们选则Ensembl Genes 84;这时出现新的下拉框-CHOOSE DATABASE- ,选择目的物种(这里以Oivs aries genes v3.1为例):

2.选择物种后,可以对数据进行设置,点击Filters,右侧出现选项,可以对基因进行选择,如果要对全部基因进行注释,则可忽略改操作;

3.点即Attributes,通过+按钮展开选项,然后勾选注释内容:

4.注释内容选择了,后点击左上方的Results,

即可显示部分注释结果(默认10行),然后点击右上角的GO按钮,即开始下载结果——mart_export.txt文件。

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