简化基因组甲基化测序(Methyl RAD)

 
 
简化基因组甲基化测序—Methyl RAD
 

Methyl RAD技术(Wang et al,Open Biol,2015)使用甲基化修饰依赖性内切酶

如FspEI、MspJL、LpnPI、AspBHI等,此类内切聘识别DNA上发生甲基化的胞晓淀

在识别位置的下游隔一定距离切割双链

 

若DNA双链具有中心对称甲基化状态

则可以切割产生一个固定长度的双链DNA片段

 

对酶切产生的标签建库测序

即可进行甲基化位点的定性和相对定量分析

 

 

 

 

欧易特色

 

文库构建简便快速,不经过片段大小选择,保证了实验的重复性

具有较强的灵活性,标签密度可控

标签长度一致,PCR扩增效率一致,测序深度均一

具有单碱基分辨率,可以做到甲基化位点的定性和相对定量分析

 

甲基化位点检测的假阳性率能够控制在0.50%以内(WGBS假阳性率在0.28%-0.50%)

提供标准和高级生物信息分析,可根据客户需求提供个性化数据分析

所需的样本DNA起始量较低

有参无参物种均可,既可用于未知甲基化位点的开发,也可用于不同样本间的甲基化位点的差异研究

 
 

 

 

推荐测序模式

 

Hiseq X-Ten , PE150·30Mreads/1G基因组大小

 

数据分析内容

 

标准数据分析

 

 

高级数据分析

 

  

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