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植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

引言

 

2019年3月至今,植物原生质体单细胞文章发表已经有8篇。通过制备原生质体的方法,借助单细胞测序技术,研究植物细胞之间的异质性,已经被广泛接受。

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

 

植物原生质体的难点

 

与动物细胞相比,植物细胞受到一层细胞壁的保护,为植物单细胞悬液的制备造成了更大的障碍。而单细胞悬液的制备作为单细胞实验的起点,是一个无法绕过的突破点。

 

究其主要原因,一方面是植物细胞由于细胞壁的存在,以及不同植物材料、不同类型细胞的细胞壁在组成成分上存在较大差异,导致没有通用的实验方法同时适用于不同植物、不同类型细胞的大规模、高质量原生质体的制备;另一方面则是因为决定植物生长发育的植物干细胞以及种子植物的早期胚胎细胞本身就数目有限,并且包裹在母体组织中难以分离。

 

欧易在植物原生质体上取得的成就

 

动物细胞之间的粘连主要依靠ECM(细胞外基质,Extracellular matrix)来建立,植物细胞之间的粘连则主要依靠细胞壁来建立。所以,去除细胞壁是制备植物单细胞悬液的必经步骤。不同于ECM,细胞壁更加稳固,我们只能采用酶解法对植物组织进行消化,去除细胞壁,获取单细胞悬液。

 

在欧易单细胞平台小伙伴们夜以继日的研发试验中,我们终于取得了里程碑式的突破,原生质体活率稳定80%以上、分离得到状态良好原生质体数量稳定106+,叶片样本更是从单片中分离得到百万以上的原生质体。

 

一览攻克历程

 

虽然目前关于原生质体制备的参考方法有很多,但是由于植物原生质体制备的难度较大,如果直接将文献中的方法原封不动照搬过来,可能只能获得类似下图的实验结果。

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

测试1

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

测试2

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

测试3

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

测试4

 

活率差、数量少,是原生质体制备后普遍存在的现象。

 

看着植物单细胞高分文章频出,望着高不可攀的单细胞上机标准,秉着以生物科技,成就他人,造福大众的使命,不就是原生质体么?办它!欧易生物单细胞实验室的小伙伴们殚精竭虑,经过不懈努力,终于成功接上了(植物单细胞)这条腿。

经过我们优化后的原生质体制备结果如下:

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

植物类型A(原生质体总数 > 1×105个,活率92%)

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

植物类型B(原生质体总数 > 1×106个,活率93%)

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

植物类型C(原生质体总数 > 1×106个,活率94%)

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

植物类型D(原生质体总数 > 1×106个,活率92%)

原生质体数量突破百万、活率稳定在80%、样本投入量一次次挑战更低,伴随着几个里程碑式的突破,曾经高不可攀的目标已经不经意间唾手可得。欧易生物单细胞小伙伴就是这么优秀!

 

欧易生物单细胞事业部介绍

 

欧易生物是国内少数具备10x Genomics和BD Rhapsody™单细胞测序双平台的机构之一,在医学和农林方向提供专业的单细胞建库测序及分析服务,包括5’端和3’端基因表达分析、免疫组库分析(TCR/BCR)、 ATAC分析和表面蛋白分析等。

 

欧易生物单细胞平台具有丰富的项目处理经验,每年成功处理单细胞样本上千例;专业的售后团队,数十位生信专家和研发工程师为您的项目保驾护航;资深的技术支持人员,优化课题设计,解读数据,让客户感受有“温度的”全面服务。

植物单细胞8连发,欧易生物原生质体分离获得重大突破

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