2bRAD-M 微生物菌群检测



产品介绍


2bRAD-M是基于2bRAD技术(Nature Methods, Wang et al. 2012)发展出的一种微生物多样性分析技术,该技术通过IIB型限制性内切酶对微生物基因组酶切后获得的唯一标签进行微生物定性和相对定量分析。

2bRAD-M技术原理如下图所示:采用IIB型限制性内切酶,如BcgI对基因组酶切,可产生等长32bp片段,这些短片段在种水平上可有效区分细菌、真菌和古菌;而且由于是等长的片段,保证了扩增效率的均一性;最后基于“两步定量法”对微生物群落进行分析,即第一步定性,第二步对候选微生物进行相对定量。该策略能够最大化地、准确检出微生物,而且可以同时检出细菌、真菌和古菌。


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产品特色


高性价比,一次测序可同时检测细菌、真菌和古菌的群落结构信息(表一)

种分类学水平(species level)的物种检测分辨率

专为特殊复杂样本而生:如低DNA起始量(pg级别)、高度降解样本(如FFPE)、高宿主污染样本(图一)

极佳的技术重复性和微生物群落客观还原度(图二)


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 △ 图一 采用由5种微生物组成的模拟样品mock设计了三种类型的微生物样本,即不同生物量样本LoA、降解样本HiD和高宿主污染样本HoC。

L2为欧氏距离,代表两个样本的相似性




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图二 2bRAD-M、16S rRNA、宏基因组三种技术的分类结果在准确性、召回率、一致性的比较




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表一 2bRAD-M、16S rRNA和宏基因组三种技术比较




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