「10x 单细胞ATAC测序」
基于10x Genomics平台，通过快速高效的单细胞标记、测序和分析，一次性获得成千上万个单细胞染色质谱，获得单细胞水平的染色质开放区域信息。高分辨率研究染色质开放程度与DNA结合蛋白调控基因的表达网络。这一技术可广泛应用于癌症，免疫，干细胞，胚胎分化发育，神经分化发育等表观修饰研究，为疾病或遗传发育等研究提供了新的思路。
（1）通量大：8通道微流体系统，每个通道一次性可捕获500-10,000个单细胞核;
（2）捕获效率高：细胞核捕获率超过65%;
（3）超低污染：线粒体序列比例小于2%（GM12878细胞系测试数据）;
（4）信息量大：获得所有染色质开放区域，不局限于某个转录因子位点或蛋白保护区域；
（5）适用范围广：可以处理细胞系、原代细胞、新鲜样品和冻存样品等;
（6）结果展示方便：官方Loupe Cell Browser提供便捷的可视化操作;
（7）低成本：每个细胞成本远低于传统单细胞ATAC测序。
（1）细胞核分离：参照10x标准流程制备细胞核；
（2）转座酶处理：利用转座酶孵育细胞核，形成片段化DNA；
（3）细胞核标记：利用10x，双十字微流体系统形成单细胞核的GEM(Gel bead in Emulsion)，每一个GEM中10x Barcodes序列是相同且特异的(Barcodes被密集连接在Gel bead上，通过Barcodes序列区分不同细胞核)；
（4）文库构建：凝胶珠溶解，细胞核破裂，片段化DNA同10x Barcodes序列连接，进行文库构建和测序，获得每一个细胞的染色体开放区域序列信息。
（1）样品浓度：5.0x106 / mL以上；
（2）细胞活性：活细胞数在65 %以上；
（3）细胞大小：小于40μm；
（4）细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+、Mg 2+和EDTA等影响酶活性的物质；
（5）建议过40μm细胞筛以除去杂质和细胞团块，细胞成团率＜5%。
