「2bRAD-M®简化微生物组」
欧易生物联合中国科学院青岛生物能源与过程研究所徐健研究员、中国海洋大学王师教授,历时5年,开发出一种全新的疑难微生物样本鉴定技术——2bRAD-M®简化微生物组技术。这一技术能处理核酸起始量低至1pg、核酸片段长度降解至50bp、微生物核酸量与宿主核酸量的比例大于1%的样本,并且能在“种”水平同时进行细菌、真菌和古菌的鉴定,技术文章于2022 年 1 月 26 日发表在国际知名期刊 Genome Biology(IF:12.3)。
相关链接:https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-021-02576-9
「技术优势」
1pg样本起始量: 2bRAD-M®简化微生物组能检测DNA量仅为1pg的样本,是宏基因组(metagenomics)可处理DNA起始量的1/500。
仅需一片石蜡样本:2bRAD-M可处理核酸片段长度降解至50bp的样本,且仅需1片石蜡切片样本,是宏基因组处理石蜡切片样本起始量的1/5,可处理保存年限超过18年的石蜡样本。
分析算法新升级:2bRAD-M从分析层面结合机器学习升级算法 MAP2B(Sun Zheng, et al. Nature Communications 14.1 (2023): 5321),高准确鉴定核心微生物, MAP2B 算法与主流宏基因组算法从精确度、召回率、F1值、L2相似性和BC相似性来比较,MAP2B 算法都是更优。
「欧易生物优势」
专利技术:2bRAD-M已获批技术商标及发明专利
(ZL 2018 1 1467986.8 、ZL 2020 1 1355328.7)
文章产出平均IF 8.1:
该技术自面市后,已累计产出合作文章33篇,累计影响因子235.4,平均 IF 达到 8.1分
其中包括Genome Biology,Gut microbiota,Advanced materials,Nature Communications等在内的10分以上文章 5 篇
丰富的疑难样本处理经验:
目前2bRAD-M®简化微生物组已处理多种疑难样本:
肿瘤组织和石蜡切片样本达数十种,包括肝癌、胃癌、结直肠癌、肾癌、前列腺癌、头颈癌、口腔癌、乳腺癌等
体液样本包括唾液、龈沟液、胃液、肺泡灌洗液、精液、尿液、乳汁、血液等
专业的售前、售后团队:专业的技术支持团队、生信分析工程师,身边的销售工程师
「不同微生物技术的对标」
表 | 2bRAD-M®简化微生物组、(5R) 16S 和宏基因组三种技术比较
「分析内容」