「Deep高深度血液蛋白质组学」

传统针对血液蛋白组的前处理策略是样本进行高丰度去除处理。其主要的原理是通过各类吸附材料对高丰度蛋白进行特异性与非特异性的结合。但是在去除高丰度蛋白的同时会带走很多低丰度蛋白 , 而丢失大部分蛋白质信息。

基于纳米颗粒的低丰度蛋白富集是近年来发展起来的一种前处理方法，其主要原理是通过混合的纳米颗粒对低丰度蛋白进行亲和吸附形成“蛋白质冠”，后续经过洗涤就可以很好地去除高丰度蛋白。混合纳米材料表面修饰了不同配基，他们对不同的蛋白序列具有特定的亲和性，可以对多种低丰度蛋白质进行富集能有效解决蛋白信息丢失的情况。

欧易生物推出Deep高深度蛋白质组和 Plus Deep高深度血液蛋白质组提升血液样本蛋白鉴定深度达3000+和 6000+新高度，大幅提升蛋白检出率，有利新的蛋白标志物挖掘和发现。

「技术流程」

「技术优势」

• 中低丰度蛋白鉴定深度3000+

• 先进级仪器平台+高深度本地自建库

• 严格的质控体系保障大队列数据的稳定可靠

• 机器学习算法标志物筛选

• 大队列项目经验，完成数千例样本检测

实测数据

应用方向

疾病早期诊断标志物、预后标志物、疾病分型标志物、诊疗标志物、机制探讨

分析内容

「结果展示」

↑ 标志物机器学习算法分析筛选标志物

「案例分享」

Rapid, deep and precise profiling of the plasma proteome with multi-nanoparticle protein corona

利用纳米颗粒蛋白冠对血浆蛋白质组进行快速，深入和精确的分析

发表期刊： Nat Commun | IF：16.6 | 实验材料： 血浆

研究流程

NP血浆孵育和蛋白冠形成、磁体纯化NP蛋白冠、蛋白冠的消化和LC-MS/MS分析

对由80名健康和61名早期NSCLC受试者组成的样本集进行分类建模，使用随机森林模型和10次重复的10倍交叉验证健康vs早期NSCLC分类的平均AUC为0.91，表明该方法在大规模临床队列的早癌筛查中有良好应用前景。

研究结论

在基于NP的分类可行性研究中重点分析了早期 NSCLC 患者样本与健康对照之间的差异，证明了该平台可在短时间内快速评估大量样本的实用性，并确定了作为下游NSCLC测试开发潜在新起点的已知和未知蛋白质的新组合。NP平台的简单性和稳健性实现了在2个星期内对141个非小细胞肺癌受试者进行了超过2000种蛋白质的定量分析，蛋白质和NPs 相互作用的精确定量使深度血液蛋白质组学研究成为现实。

文章解读

https://mp.weixin.qq.com/s/Ynxsr0S7N-VQtn6_QMjnWw

「送样指南」

1、样本送样量要求

说明：适用于任何含有高丰度蛋白体液样本

2、样本采集与处理

1）血浆

• 使用抗凝管采集全血，颠倒混匀 8~10 次，采血后30min内进行离心，不能出现溶血或凝血现象，4 度 1500×g 离心 10 min，取上清；

• 用移液器将血浆转移到离心管中，每管0.2 mL，加入蛋白酶抑制剂，混匀，瞬时离心；

• 液氮速冻 5min，保存于-80℃（若无液氮，可立即保存至-80℃冰箱）。

注意：优先推荐使用EDTA-K2抗凝管，样本提前做好分装用于不同的检测研究。

2）血清

• 使用真空采血管收集血液，轻轻地上下颠倒混匀 5~6 次，

• 4°C 静置 30-60min，让全血凝集；

• 4 度 1500×g 离心 10min，取上清；

• 用移液器将上层淡黄色血清转移到离心管中，每管0.2 mL，加入蛋白酶抑制剂，混匀，瞬时离心；

• 液氮速冻 5min，保存于-80℃（若无液氮，可立即保存至-80℃冰箱），干冰寄送。

3）其他体液参考

• 1500×g 离心 5min，使用 0.22μm  滤膜过滤，取上清，液氮速冻 5min，-80℃保存（若无液氮，可立即保存至-80℃冰箱），干冰寄送。