10x Visium 空间转录组


「10x Visium 空间转录组




10x Visium常规空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域,每个捕获区域大小为6.5mm × 6.5mm,含有5000个spots,每个spots直径为55 μm,两个spots中心之间的距离为100μm。每个spots上都带有上百万个可以与mRNA结合的捕获探针,每个探针上都带有独特的spatial barcodes,用来表征空间信息。

每个spots中引物上的UMI都不同,用以量化转录本并去除PCR Duplications,实现绝对定量。当RNA从组织切片的细胞中释放出来后,迁移到每个点的RNA被引物末端的Oligo-dT捕获,之后进行文库构建并进行测序。接下来,根据数据的 Spatial Barcode 对数据进行分配,以确定哪些数据来自哪个位置,最终实现空间基因表达的可视化。



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图 | 10x Visium空间转录组测序玻片捕获区结构(来源/10x Genomics)



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图 | 10x Visium空间基因表达技术原理示意图(来源/10x Genomics)





「技术优势




  • 广泛的样本适用性:适合大多数组织类型

  • 简单的操作流程:一个工作日内可完成从组织切片到文库的工作流程

  • 较高的分辨率:每个捕获区域包含 5000 个 spots,每个 spots 捕获平均 1-10 个细胞

  • 易于与组织学分析的实验室方法和工具集成





「欧易生物优势




成果转化行业领先:以文章产出为导向,时空多组学(单细胞转录组+空间转录组+空间代谢组)帮助客户转化文章超260篇(行业前3),致谢率80%(行业领先);挂名文章10篇(行业领先)


经验丰富:欧易是行业第一梯度开展高通量单细胞转录组和空间转录组的公司,空间转录组累计完成1000+项目,已完成切片的冰冻样本1500+、FFPE样本200+、样本类型50+


实验质控严格:针对于客户样本,对除了活性以外的碎片率、结团和细胞状态等做充分评估,保证数据质量


服务客户的使命必达:售后问题不推脱,解决迅速


欧易提供「团队式」的售后处理模式

  • 团队中技术支持作为项目主导,及时跟进项目,提供以下(但不限于)项目支持工作,包括分析内容解读,相关问题答疑,结果讨论,下一步工作计划,文章思路讨论,文章撰写建议等

  • 团队中销售主要跟进产出,提供结果交付,项目会议协调等工作

  • 团队中生信工程师提供单细胞相关标准分析、高级分析、个性化分析等内容的输出


「团队式」的售后处理模式项目跟进速度快:可随时联系到技术支持和分析人员,不额外设定分析次数(避免了分析超额多收费的现象),提供个性化分析内容(不会某些分析做不了或者不愿意尝试)


空转多组学联合转化行业第一

  • 欧易生物是第一个转化空转+空代多组学的公司(NC)

  • 欧易生物也是第一个同时转化单细胞+空转+空代的公司(NCB)

  • 空转整体发文量行业前3





「分析内容




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