常见问题
1. 如何确定是选择构建核系统文库还是膜系统文库？
主要是根据所关注的诱饵蛋白在细胞内的定位情况来确定：
如果诱饵基因是定位在膜上的蛋白则选择膜系统文库；
如果诱饵基因是定位于核则选择核系统文库；
如果诱饵基因有跨膜区也可以考虑把跨膜区切除后用核系统文库筛库，但是这样操作有一定风险；
如果诱饵基因是定位在细胞质，可以选择核体系或者膜系统文库。
2. mating 和共转两种筛库方法到底哪种好？
两种方法各有千秋，没有所谓的好与不好，主要根据实验条件和操作习惯。
只要操作和 BD 构建没有问题都不会影响筛库的效率，可以选择任意一种方法进行筛库。
3. 如果诱饵蛋白有毒性怎么办？
可以使用低拷贝的 pGBT9 质粒构建诱饵载体；
在某些情况下，在液体培养基中培养不好的菌株可以在固体培养基上生长得很好。
首先重悬克隆于 1 ml 的 SD/–Trp；
接着将重悬液平铺于 5 个 100 mm 的 SD/–Trp 平板，在 30℃ 下温浴，直至平板上的克隆相互粘在一起；
5 ml 0.5X YPDA 刮下每块板上的克隆，并收集到一管中。这样就可以使用这个该细胞重悬液进行正常的杂交反应。
4. 如果诱饵蛋白有自激活怎么办？
如果诱饵蛋白有自激活现象，建议找出该蛋白的激活区域，然后将激活区域删除后重新构建 BD 质粒。
如果自激活不严重，可以通过增加筛选的严谨度（培养基中添加适当浓度的 3-AT）继续进行筛选。
5. 其他注意事项
菌落变红不是污染，是酵母细胞生长中一个常见现象：
当细胞在平板培养几天后，平板上的 Adenine 被酵母消耗完毕，酵母试图通过自身代谢途径合成 Adenine 以供利用。然而，有些菌株的 ADE2 基因被破坏，Adenine 合成途径受阻；又由于其 ADE4, 5, 6, 7, 8 基因均正常，所以造成中间产物 P-ribosylamino imidazole (AIR) 在细胞中积累而使菌落变为粉红色。
