DIA定量蛋白组质组学「力荐」


4D-direct DIA 定量蛋白质组技术




DIA 重复性高,定量准确,适合大队列样本的分析,但因其全扫描的性质,谱图解析较为困难,需要预先建立图谱库,增 加了额外的建库成本。Direct DIA(direct Data-independent acquisition),即 Library-free DIA,与传统 DIA 分析策 略相比,无需进行 DDA 分级构建图谱库,直接利用机器深度学习解析 DIA 质谱原始谱图,在保留了 DIA 高通量、高重现、 高准确的特点的同时提高了效率、缩短了实验周期、降低了成本。





技术流程



 

4D-direct DIA 定量蛋白质组技术





技术优势




无需进行 DDA 分级建库,周期更快、成本更低

与 DDA 相比缺失值少、鉴定蛋白数目多

样本量要求更低,更适合微量样本检测 

高通量、高重现、高准确





应用领域




医学:疾病标志物发现、药物靶点筛选、疾病机制研究等

植物:抗逆胁迫机制、生长发育机制等

畜牧业:品质研究、动物营养、品种繁育等

食品环境:储藏加工条件优化、品质鉴定、食品营养





研究案例




Proteome profiling of cerebrospinal fluid reveals biomarker candidates for Parkinson’s disease 

脑脊液蛋白质组分析揭示帕金森疾病标志物

发表期刊:Cell Rep Med  | IF:16.988  | 实验材料:脑脊液



研究流程


4D-direct DIA 定量蛋白质组技术

4D-direct DIA 定量蛋白质组技术


研究结论 


该研究是全球顶尖蛋白组学研究团队之一 Matthias Mann 团队力作,扩展了基于质谱的蛋白质组学工作流程,分析了帕 金森疾病组与对照组的脑脊液样本,采用 direct DIA 定量蛋白质组从微量样本中重复量化超过 1700 种蛋白质,通过机 器学习确定了 LRRK2 G2019S 携带者特有的生物标志物特征。与团队之前进行的尿液蛋白质组研究结果进行比较,发 现在两种体液中都可以识别出相似的帕金森和 LRRK2 相关的蛋白质组变化,为理解帕金森发病机制提供了新途径,以 进一步寻找潜在生物标志物。





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