「DIA定量蛋白质组学」

DIA 为定量蛋白质组学主流质谱技术，相较传统 DDA 选择性碎裂离子的检测方式，可高效检出样品中低丰度蛋白。该技术采用循环全质量窗口全覆盖碎裂模式，一次性采集窗口内所有母离子与子离子信息，具备高通量、高分辨率、定量重复性优异等特点，样本无需预分级，是大样本队列蛋白研究的优选技术。

欧易生物研发的 DIA 定量蛋白质组产品依托 Thermo Orbitrap Astral、Bruker timsTOF HT 两大高端质谱检测平台，无需自建谱图库，依托全域扫描优势优化整套实验方案：显著提升蛋白鉴定数量、减少定量缺失值，数据平行性与稳定性大幅改善，极大缩短检测时长，兼顾更高检测通量与更深蛋白覆盖。

「两大质谱仪器平台介绍」

Thermo Orbitrap Astral：新一代旗舰轨道阱质谱，超高分辨，深挖低丰度蛋白，蛋白鉴定深度顶尖、定量精准稳定，侧重高覆盖深度测序。

Bruker timsTOF HT：搭载离子淌度技术，HT 代表高通量，扫描速度快、上机效率高，样本检测通量优异。

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「技术流程」

「技术优势」

高深度：在DIA定量方法上对色谱及质谱条件进行升级，蛋白鉴定深度进一步提升

高通量：具有更高的检测通量，更适合大队列样本检测

高稳定性：样本检测重复性稳定性更高

无需额外建库：本地自建库+机器深度学习算法，深度数据解析，提升蛋白鉴定深度和准确度

「欧易生物优势」

丰富的项目经验：10余年蛋白质组学项目经验，拥有超20种蛋白提取检测方案

自动化前处理：标准流程减少人工操作误差，高通量，高稳定性

严格的质控：全流程严控蛋白提取、质谱上机与生信分析各环节质控，保障数据的可靠性和稳定性

丰富的生信分析内容：常规及高级分析满足多维度需求，Top期刊级美图满足文献发表要求

「实测数据展示」

「应用领域」

适合于各种类型细胞、组织和体液等样本，无通量限制适用于各种样本数量的检测，对大规模样本的检测展现较好的优越性（例如临床大队列研究），高深度蛋白鉴定数量需求，样本差异大，关注“有和无”极端差异蛋白的研究。

医学：疾病机制研究、疾病标志物发现、药物靶点筛选

植物：抗逆胁迫机制、生长发育机制，育种保护研究等

畜牧业：品质研究、动物营养、品种繁育等

食品环境：储藏加工条件优化、品质鉴定、食品营养

「分析内容」

「结果展示」

「案例分享」

Noninvasive proteomic biomarkers for alcohol-related liver disease

精相关性肝病的非侵入性蛋白质组学生物标志物

发表期刊： Nature Medicine | IF：82.9 | 实验材料： 肝和血浆

「研究流程」

以人肝脏、人血浆为研究对象，采用DIA蛋白组学分析了酒精性肝病患者和正常对照的肝和血浆蛋白组，找到了差异蛋白，然后通过机器学习算法确定了三组蛋白生物标志物组合，这些组合具有良好的诊断准确性和预后能力。

总共有420种蛋白质在肝脏和血浆中被定量，其中46种蛋白质在肝脏和血浆蛋白质组中共失调，主要参与免疫和炎症反应、细胞粘附、ECM组织、蛋白酶抑制剂和细胞内酶等过程。

作者筛选出了由9个生物标志物蛋白组合来识别显著纤维化，6个蛋白组合用于识别轻度炎症活动以及12个蛋白的组合来识别肝脂肪变性。三个生物标志物组合共含有22个蛋白，有7种在血浆和肝脏中均有共调节。基于所选标记物组的Logistic回归模型的交叉验证显示三种组合的平均ROC-AUC分别为0.90（显著纤维化）、0.85（轻度炎症活动）和0.91（脂肪变性）。

「研究结论」

酒精相关性肝病（ALD）是全球肝脏相关死亡的主要原因，但对该疾病的三个关键病理特征 ：纤维化、炎症和脂肪变性的了解仍然不完整。研究者使用配对的肝-血浆蛋白质组学方法来推断分子病理生理学。并探索血浆蛋白质组学在596人中的诊断和预后能力。然后使用机器学习模型确定了蛋白质组学生物标志物组合，这些组合在检测显著纤维化和轻度炎症上比现有的临床检测更准确。此外这些生物标志物组合在预测未来肝脏相关事件和全因死亡率方面是准确的。

「点击原文解读」

https://mp.weixin.qq.com/s/F-sI-0EY-c08GW_xVOWreg

「送样指南」