「DIA定量蛋白质组学」
数据非依赖采集(Data independent acquisition,DIA)是近年来备受瞩目的质谱采集技术之一,一度带领了定量蛋白质组学新发展。DIA相比于DDA的优势在于高效测定复杂样品中相对低丰度的蛋白分子,大幅提高了定量分析的可信度。其原理是在质谱数据采集时,高速、循环的将每个采集窗口内的所有母离子及其碎裂后的子离子进行全扫描,而非根据母离子信号强度筛选后进行二级碎片再扫描。因此DIA具有高通量、高分辨率、高可重现性、定量准确等优点,而且样本无需分级上机,大大的缩短了每个样品的检测时间,适合大样本量的蛋白质组研究。
欧易生物研发的Pro DIA定量蛋白质组延续了DIA定量方法,全景式无遗漏扫描,蛋白鉴定数量更多、定量更准确,缺失值更少,结果更稳定,周期更快,提高定量的稳定性与平行性,大幅提高检测通量和鉴定深度,特别是展现了在大规模样本蛋白质组分析中的优越性。
「DIA技术分类介绍」
4D-DIA:DIA 采用全扫描进行图谱信息收集,图谱信息的复杂程度比较高,早期没有专门的非常好的算法对其进行图谱解析及蛋白定性定量,因此采用一种中间桥梁的图谱解析方法,即用DDA 库作为中间桥梁来协助DIA 数据的解析。DIA 原始图谱数据基于DDA 库进行肽段/蛋白定性定量。
4D-direct DIA:Direct DIA即Library-free DIA,与传统DIA分析策略相比,无需进行DDA分级构建图谱库,直接利用机器深度学习解析DIA质谱原始谱图,在保留了DIA高通量高重现高准确的特点的同时提高了效率、缩短了实验周期、降低了成本。与Label free相比,蛋白鉴定数目更多,定量更准重复更好,可完全替代。
Pro DIA「推荐」:是Direct DIA的升级版,对色谱及质谱条件的多方面升级,该技术服务延续了DIA定量方法,全景式无遗漏扫描,同时引入了欧易生物高深度本地自建库,采用hybrid搜库策略,蛋白鉴定数量更多、定量更准确、缺失值更少、结果更稳定、周期更快,提高定量的稳定性与平行性,大幅提高检测通量,同时也保证了蛋白的鉴定深度,展现了在大规模样本蛋白质组分析中的优越性。
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「技术流程」
「技术优势」
高深度:在DIA定量方法上对色谱及质谱条件进行升级,蛋白鉴定深度进一步提升
高通量:具有更高的检测通量,更适合大队列样本检测
高稳定性:样本检测重复性稳定性更高
无需额外建库:本地自建库+机器深度学习算法,深度数据解析,提升蛋白鉴定深度和准确度
「欧易生物优势」
丰富的项目经验:10余年蛋白质组学项目经验,拥有超20种蛋白提取检测方案
自动化前处理:标准流程减少人工操作误差,高通量,高稳定性
严格的质控:15重严格质控标准,保障数据的可靠性和稳定性
丰富的生信分析内容:常规及高级分析满足多维度需求,Top期刊级美图满足文献发表要求
「实测数据展示」
「应用领域」
适合于各种类型细胞、组织和体液等样本,无通量限制适用于各种样本数量的检测,对大规模样本的检测展现较好的优越性(例如临床大队列研究),高深度蛋白鉴定数量需求,样本差异大,关注“有和无”极端差异蛋白的研究。
医学:疾病机制研究、疾病标志物发现、药物靶点筛选
植物:抗逆胁迫机制、生长发育机制,育种保护研究等
畜牧业:品质研究、动物营养、品种繁育等
食品环境:储藏加工条件优化、品质鉴定、食品营养
「分析内容」