多组学联合分析

 
多组学联合分析
生命发展机理包含了多层次、多水平和多功能的复杂结构体系,
借助高通量技术发展积累的大量组学信息和数据,整合多组学数据可以对生物系统进行更全面的了解。
 
技术路线
 
 
 
 
转录组、蛋白组、代谢组专题
通过对转录组、蛋白组和代谢组数据联合分析,
揭示不同组学在多个层次上全面探究生命活动的机理、疾病发生的机制,
精确研究重要基因的表达模式和调控过程,进而透视生命活动的规律与本质,解释生物学问题。
 
 
 A. mRNA与蛋白的表达聚类分析; B. 差异基因、蛋白和代谢物 KEGG 注释通路图
 C. 差异基因和代谢物的 KGML 网络图;D. 差异基因与差异代谢物相关性热图
 
 
转录组调控专题
通过miRNA-转录组(mRNA/circRNA/lncRNA)负调控关联分析,
获得miRNA与特定转录本间的负调控关系对,并构建miRNA负调控网络图;
在miRNA与转录组共表达基础上构建ceRNA模型以及ceRNA调控关联网络图;展示lncRNA与差异基因的信息。
 
 
E. miRNA与mRNA/circRNA/lncRNA负调控关联网络图;
F. 差异表达gene和lncRNA的circos图
G. ceRNA调控关联网络图
 
 
表观遗传专题
表观遗传主要是研究基因序列不变,
基因的表达、调控和形状发生了可遗传的变化的分析机制。
研究对象主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰等。
H.转录因子或染色质调节因子的调控潜能预测;I. 差异基因和甲基化四象限图
 
 
基因组专题
拷贝数变异(Copynumber variation,CNV)表现为基因组片段的拷贝数增加或者减少,
是基因组结构变异(Structural variation, SV)的重要组成部分,
分为缺失(Deletion)和重复(Duplication)两种类型,是一种重要的分子机制。
CNV 能够导致包括癌症在内的复杂疾病,对于染色体水平的缺失、扩增的研究已经成为基因组研究热点。
 
 
 
J. CNV和表达量关联图
 
 
微生物专题
用多组学解析环境微生物的组成和功能,
多个组学同时整合以实现多重角度互相验证,
为全面解析微生物环境群落中的重要物种和基因信息提供了一种有效的手段,
可进行微生物多样性或宏基因组和其他组学关联分析。

 
K. 差异OTU/门/纲/目/科/属/种与差异代谢物表达相关网络分析
L. 差异微生物与差异代谢物表达相关网络分析
M. 指定微生物及其共现代谢物 paired heatmap

 

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