超微量蛋白质组学


超微量蛋白质组学




蛋白质组学驱动的精准医疗受到了越来越多的关注。生物样品中蛋白质的存在与否和丰度高低是蛋白质组学研究的焦点。 通常蛋白质组学研究需要大量的蛋白质,而在相当多的应用场景中能够获得的蛋白量非常有限,例如通过流式细胞术、 超速离心等分选获得的细胞、亚细胞样本、临床上针对肿瘤检测的穿刺样本、病理切片组织、微量体积的体液样本等。 基于质谱的蛋白质组学鉴定随着软硬件技术的发展,实现了极微量且更加精准的蛋白表达谱鉴定,已经由传统的常规蛋 白质组学进入到了极微量样本蛋白质组的时代。目前微量蛋白质组学驱动的精准医疗通过对临床样本的质谱检测实现 发现疾病标志物,以及药物靶标的发现和验证正成为研究的热点。






技术流程





超微量蛋白质组学






技术优势




高:通量高、不受样品数量的限制;蛋白肽段回收率高;仪器平台灵敏度分辨率高

低:样本用量需求极低,样本处理损失率低,满足了珍稀样本研究要求

稳:标准的操作流程及严格的质控,保证数据稳定性重复性可靠性

全:采用DIA全景式质谱扫描,有利于低丰度蛋白检测,蛋白检测种类更全面

广:适用样本类型范围广:组织、细胞、切片和体液等

深:对极微量获得高深度蛋白质组学数据,有利于数据深入挖掘





应用领域




微量/稀有样本研究

FFPE石蜡组织/切片

OCT包埋冰冻切片

生殖细胞研究

穿刺样本研究




研究案例




Proteomic characterization of gastric cancer response to chemotherapy and targeted therapy reveals new  therapeutic strategies

胃癌对化疗和靶向治疗反应的蛋白质组学特征分析揭示了潜在的治疗策略

发表期刊:Nat Commun  | IF :17.694  | 实验材料:胃癌患者 FFPE



研究流程


超微量蛋白质组学



研究结论


研究团队对 206 例接受化疗或抗 HER2 治疗的 GC 患者 FFPE 肿瘤组织的蛋白质组进行了分析。基于蛋白质组的分类揭示了与不同临床和分子特征相关的四种亚型。高 MSI-sig 的 GC 患者受益于多西紫杉醇联合治疗,并伴随抗癌免疫反应。 进一步研究表明,高 T 细胞受体信号传导的患者对基于 HER2 的治疗有反应;而细胞外基质 /PI3K-AKT 通路的激活损 害曲妥珠单抗的抗肿瘤作用。CTSE 作为多西紫杉醇化疗敏感性的细胞内增强剂发挥作用,而 TKTL1作为衰减剂发挥作用。 研究开发了预测治疗反应的高精度预后模型,并在独立验证队列中进一步验证,为研究胃癌化疗和靶向治疗的机制和指 标提供了丰富的资源。





立即咨询