双平台全谱代谢组学「力荐」


双平台全谱代谢组




不同的质谱平台灵敏度及偏向性都不一样,而且不同平台之间具有互补性。LC-MS 平台对代谢物的覆盖最广、灵敏度更高, 相比于 GC-MS,无需衍生处理。LC-MS 平台可以检测到的物质峰可以达到几千甚至上万,有定性信息的物质在 1000 个以上。 GC-MS 可以作为 LC-MS 热稳定化合物的一种补充,一般 GC-MS 平台可以定性到的代谢物在 200 个以上。

服务介绍





技术流程




服务介绍





服务优势




项目经验:已落地行项目 5000+,拥有 50+ 代谢标志物筛人选项目实战经验


覆盖度广: LC-MS/MS+GC-MS/MS 双平台液质和气质双力,代谢物检出量显著提升,实现强极性 + 弱极性 代谢物全覆盖。全面提升鉴定的准确性和数量


分析丰富:包含单维和多维统计分析、相关性分析、通路分析、个性化分析等


数据库全:拥有自主产权 GCMS LUG 库 ( 含内源性小分子标准品1500 个 ) 和医学类 LCMS 自建库 EMDB( 含内源性小分子标准品 2500 个 ) 及植物类 LCMS 自建库 PMDB(6000+) 


质控严格:从样本前处理质控,到残留评估、组间质控、组内质控、数据处理质控五大质控过程为结果保驾护航


服务介绍





代谢组数据库展示




不同的质谱平台灵敏度及偏向性都不一样,而且不同平台之间具有互补性。LC-MS 平台对代谢物的覆盖最广、灵敏度更高, 相比于 GC-MS,无需衍生处理。LC-MS 平台可以检测到的物质峰可以达到几千甚至上万,有定性信息的物质在 1000 个以上。 GC-MS 可以作为 LC-MS 热稳定化合物的一种补充,一般 GC-MS 平台可以定性到的代谢物在 200 个以上。


LC-MS


1、自建数据库(EMDB2.0)

针对人、动物内源性代谢物建立的专属质谱数据库,包含标准品数据库和人工校对数据库, 含内源性小分子标准品 2500 个,总库容量 10000 个。

主要包括氨基酸及其衍生物、有机酸及其衍生物、碳水化合物及衍生物、有机杂环类、核苷类及衍生物、吲哚类及其衍生物、类固醇及衍生物、胆汁酸及衍生物、酰基肉碱类、溶血磷脂类、 苯类及暴露组相关的等共计 13 大类代谢物,涵盖糖酵解 / 糖异生、TCA 循环、苯丙氨酸代谢、色氨酸代谢、类固醇生物合成、 类固醇激素生物合成、初级胆汁酸生物合成、甘油磷脂代谢等几十余条重要代谢通路。


2、三大公共数据库

  • HMDB 5.0 版本(含有 132335 种代谢途径,覆盖了 136878 种代谢物或外源性物质)

  • METLIN 数据库(包含 85,000 个代谢物标准 MS/MS 图谱) 

  • Lipidmaps 数据库(收录超过 8 大类、4 万种脂质,300 种亚类、170 万种脂质分子的 MS2 & MS3 数据库)



GC-MS


1、自建数据库

具有自主知识产权的 GC-MS 数据库—LUG 4.0(Untarget database of GC-MS from Lumingbio,Version 4.0), 专利号:ZL202010401911.0,含内源性小分子标准品 1500 个,总库容量 3000 个。覆盖了包括脂类、氨基酸、脂肪酸、胺类、 醇类、糖类、氨基糖类、糖醇类、糖酸类、有机磷酸盐类、羟基酸类、芳香类、嘌呤类和甾醇类等多种物质。

LUG 数据库中的代谢物含有 HMDB, KEGG, CAS 识别号、物质分类等内容,信息更全面,方便后续进行代谢物功能研究。





应用方向




临床和疾病:疾病标志物发现、愈后效果评价、疾病诊断、疾病发病机制等


植物和微生物:基因功能解析、植物代谢网络调控机理、植物与生物逆境和非生物逆境互作研究、植物品质性状和育种研究、微生物突变体筛选和功能基因解析等


中药:中药质量控制、安全性和毒性研究、中药整体疗效药效物质基础及作用机制的研究,中药作用模型的鉴别和确证、中药方剂


药物:药物毒物作用机制研究,药物毒性和安全性评价药物临床效果评价、药效筛选等


食品安全和营养学:农兽药在动植物体内的相关生物标志物发现、作物营养成分及安全评估、营养素与机体相互作用营养素与机体相互作用、营养在疾病发生发展的作用、农作物营养成分及安全评估等




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