喜讯!欧易生物再添重磅技术利器!欧易生物正式成为中国科学院分子植物科学卓越创新中心FX-Cell 技术国内唯一指定服务商,正式推出由王佳伟团队原创研发的 FX-Cell 植物单细胞转录组测序定制服务。从此,难消化组织、冻存样本、田间材料不再是科研拦路虎,欧易生物将为您提供最接近体内真实状态的单细胞数据解决方案!
在植物科学研究中,单细胞转录组测序已成为揭示细胞异质性的核心利器。然而,该领域仍面临诸多挑战:植物细胞壁难以高效消化、田间样本无法实时处理、传统原生质体制备耗时较长易诱发人为胁迫、单核测序会丢失胞质来源的转录本信息,这些问题持续制约着植物单细胞转录组技术的发展和广泛应用。
2025年11月,中科院分子植物卓越中心王佳伟团队联合斯坦福大学在Nature Methods发表的“ FX-Cell: a method for single-cell RNA sequencing on difficult-to-digest and cryopreserved plant samples” 推出了一套革命性的解决方案——FX-Cell 系列技术。该技术一举攻克植物scRNA-seq长期痛点,让田间作物、难破壁组织、-80℃冻存样本都能产出高质量单细胞数据!

一
技术核心:化腐朽为神奇的“固定后消化”
传统方法依赖活细胞的原生质体分离,而FX-Cell则通过以下创新解决了质量控制难题:
1. 先固定,后解离,锁定细胞原始状态:利用Farmer's solution快速固定,锁定细胞原始生理状态。
2. 高温消化+优化酶配方:实验显示,固定后的细胞更为稳定,能够耐受 50°C 的高温酶解。在高温下,纤维素酶活性达到巅峰,使得原本坚硬的木质化组织也能被彻底解离细胞释放,效率比传统方法提升了10到364倍(图1a, 1c)。对于难消化组织,如水稻分蘖节、野生稻根状茎、蕨类植物,通过优化酶配方,细胞释放量显著增加(图1d)。
3. 独创RNase清除技术,锁定高质量RNA:研究团队开发了基于GMP-Sepharose柱的纯化方法,有效去除了酶液中的RNase污染(图1e) 。通过固定处理的样本,其RNA完整度保持在较高水平(如玉米花药平均RIN达9.3),再经过高温消化及RNase去除酶液解离后,最终获得的细胞RNA RIN约为 6.7,这一数值显著优于未经纯化的商业酶解离结果(RIN 仅 4.1),完全满足高质量单细胞文库构建需求(图1f) 。

图1. 固定和高温酶解可高效释放植物单细胞
二
性能巅峰:FX-Cell 为什么是植物单细胞的“最优解”?
在与现有技术的对比中,FX-Cell展现了全方位的优势:
● 更高的数据质量:在水稻根尖测试中,FX-Cell捕获的细胞数量和每个细胞检测到的基因中位数显著高于snRNA-seq(图2a-c)。FX-Cell 生成的细胞图谱与传统原生质体法去除批次效应后能重合,能够精准识别表皮、皮层、维管柱等各类细胞群(图2f-h)。
● 捕捉真实的“瞬时响应”:FX-Cell 能够在取材时就锁定样本转录组(图5a),精准捕获拟南芥叶片受损后的急性早期响应,避免了传统方法中长时间酶解产生的人工伤口基因干扰(图5c, 5d)。

图2. FX-Cell 用于高通量单细胞测序的开发与评估
表1 传统 scRNA-seq、snRNA-seq、FX-Cell技术对比分析

三
四大应用场景,解锁研究新高度
1. 野外采样,即刻锁定:利用cryoFX-Cell,研究者在田间采集玉米冠根后直接速冻并 -80°C保存50天。测序结果成功回收了绝大部分根系细胞类群,实现了“田间采样,回实验室测序”(图4d)。
2. 长期保存,灵活实验:以水稻根尖样本为例,无论是“先固定再冷冻”(FXcryo-Cell, 图3a)还是“先冷冻再固定”(cryoFX-Cell, 图3b),解离后的细胞形态均保持良好(图3c),为大规模样本收集提供了极大的便利 ,可以实现多批次样本,集中上机,极大降低了实验成本和批次效应风险(图3a-c)。
3. 攻克“难破壁的痛”:利用 FXcryo-Cell,研究者成功构建了水稻分蘖节(图4a)和野生稻地下茎(图4b)的高质量细胞图谱,这些组织在传统方法下几乎无法被消化。
4. 零人工干扰,捕获“真实胁迫响应”(图5):FXcryo-Cell能够瞬间固定样本,首次在单细胞分辨率下精准还原了拟南芥叶片受损后的早期急性响应。研究发现,传统原生质体法(Trad. scRNA-seq)在制备过程中会产生类似创伤反应的人工干扰基因,而 FX-Cell 从根源避开人工干扰,可以获得更接近体内真实状态的转录组数据(图5c, 5d)。在实际农业与育种研究中,这一核心优势可以用于干旱、盐碱、高低温、病原菌侵染等各类环境和生物胁迫,真实解析植物瞬时逆境应答响应。

图3. FXcryo-Cell与cryoFX-Cell在水稻根尖样本中的应用

图4. FX-Cell在难消化及冷冻保存植物样本上的应用

图5. 利用FXcryo-Cell技术在单细胞分辨率下探究拟南芥叶片的伤口响应
2026年4月21日,欧易生物正式成为FX-Cell技术国内唯一指定服务商,全面引进并商业化落地由王佳伟团队原创研发的 FX-Cell植物单细胞转录组测序技术,并正式推出 FX-Cell定制化测序服务。
无论您的样本是珍稀的野外物种,还是难破壁组织,我们都能为您提供从样本固定、长途冷冻运输到高质量测序分析的全流程解决方案。
FX-Cell技术的出现,标志着植物单细胞研究进入了“全组织、全场景、高精度”的新时代。
欧易生物,助力您的植物研究突破壁垒,探索单细胞领域的无限可能!
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原文链接:https://doi.org/10.1038/s41592-025-02900-2






