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1、微生物多样性测序:解锁生命奥秘,助力人类健康
在浩瀚的生命世界中,微生物以其独特而多样的存在方式,扮演着不可或缺的角色。它们无处不在,从深海的极端环境到陆地的肥沃土壤,从寒冷的冰川到炎热的热泉,微生物的足迹遍布地球的每一个角落。微生物多样性测序,正是我们探索这一微观世界、解锁生命奥秘的一把钥匙。
微生物多样性测序技术,利用高通量测序平台,对微生物群落的基因组进行深度测序和分析,从而揭示其种类、数量、分布和功能等信息。这一技术的出现,极大地推动了微生物学、生态学、环境科学等领域的研究进展,为我们理解生命系统的复杂性和多样性提供了新的视角。
应用领域
1、探究不同环境或生理状态下的菌群组成及差异变化
2、作为疾病诊断、预后和个性化治疗的新型生物标志物(biomarker)
3、微生物在病理或生理中的功能机制研究
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2、全外显子组测序:解锁生命密码
全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。人类基因组大约有1.8×105个外显子,序列总长约30Mb,占人类基因组的1%。研究表明,人类85%以上的疾病基因是由外显子上的碱基突变造成的,因此相比于全基因组测序可以获得更综合的数据信息,全外显子组测序只针对外显子区域的DNA进检测,目标区域更加明确,覆盖度更深、数据准确性更高,也更加经济,尤其适用于大队列样本的研究。
1、肿瘤驱动基因研究;
2、复杂多基因疾病研究;
3、家族遗传病/罕见病研究
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3、蛋白质组学研究:机制研究及标志物发现
蛋白质,作为生命活动的主要执行者,不仅参与了生物体的每一个细微过程,还承载着生命的多样性和复杂性。蛋白质组学,正是研究这些蛋白质在细胞、组织乃至整个生物体中的表达、结构和功能的科学。
通过蛋白质组学的研究,我们可以更深入地了解蛋白质在生物体中的调控机制,揭示疾病发生的分子机制,为疾病的预防、诊断和治疗提供新的思路和方法。同时,蛋白质组学还可以帮助我们更好地认识生物的进化、适应和多样性,为生物多样性保护和资源利用提供科学依据。
应用领域
1、医学疾病机制研究,生物标志物发现
2、植物抗逆胁迫机制、生长发育机制研究
3、畜牧业品质研究、品种繁育等
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4、磷酸化修饰蛋白质组研究
蛋白质翻译后修饰(Post-translationalmodification, PTM)指的是通过在一个或多个氨基酸残基上加上修饰基团,可以改变蛋白质的物理、化学性质,进而影响蛋白质的空间构象和活性状态、亚细胞定位、折叠及稳定性以及蛋白质之间的相互作用。
随着对一些疾病逝行深入的研究后发现很多生理病理疾病的发生真实不仅仅跟蛋白本身的表达量相关,有些情况下蛋白的表达并没有明显的变化但是由于一些复杂的翻译后修饰的改变从而影响了整个分子机制的改变,因此对样本进行蛋白翻译后修饰的研究就显得尤为重要。
应用领域:
1、医学疾病机制,疾病标志物发现、靶点筛选等研究
2、植物抗逆抗病机制、生长发育机制、品质性状等研究
3、常与常规蛋白质组联合分析,进一步在修饰表达水平对生物学问题进行更深入的研究
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5、酵母杂交筛库:分子互作研究利器
酵母杂交筛库是一种利用酵母杂交技术进行大规模文库筛选的方法,用于鉴定蛋白质、DNA等分子互作。酵母双杂交筛库可以快速鉴定出与特定“诱饵”蛋白相互作用的“猎物”蛋白。酵母单杂交筛库可以快速鉴定出与特定“诱饵”DNA相互作用的“猎物”蛋白。
应用领域:
1、蛋白质相互作用网络:通过双杂筛库可以快速识别大量与特定蛋白质相互作用的伙伴,有助于构建蛋白质相互作用网络。
2、DNA-蛋白质相互作用网络:通过单杂杂筛库可以构建DNA-蛋白质互作网络,解析基因调控的上游机制。
3、基因功能研究:通过分析蛋白质相互作用,推测基因的功能。
4、药物靶点发现:识别与疾病相关的蛋白质相互作用,为药物开发提供潜在的靶点。
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6、空间原位技术10x Xenium
Xenium原位分析技术通过多轮荧光成像的方式,可以在新鲜冷冻(FF)组织或福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本中,以单细胞/亚细胞分辨率,对数百个RNA靶点进行高灵敏度、高特异性检测,实现在亚细胞分辨率水平检测靶基因在组织原位中的表达。针对不同组织类型和研究方向,可灵活定制需要检测的靶向基因(Panel)。
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