宏基因组测序


宏基因组测序

 



宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学。以特定生境中的整个微生物群落为研究对象,采用高通量测序技术,获得环境微生物基因组信息总和,以研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能以及代谢通路等。宏基因组测序技术促进了微生物资源的开发利用,并加速了微生态科研进程的深度研究。



技术优势

 



全面性:宏基因组测序提供了对整个微生物群落基因组的综合视角,而不仅限于16S rRNA基因。这意味着它能够捕捉到更广泛的微生物多样性,包括细菌、古菌、真菌以及病毒。

功能信息:宏基因组测序不仅能够鉴定微生物群落中的物种,还能提供关于它们潜在功能的信息。这是因为它涵盖了微生物基因组中的所有基因,因此可以用于探究微生物群落的代谢途径和功能潜力。

更高的精确度:宏基因组测序能够提供更深入的物种水平分辨率。与16S rRNA基因测序相比,它能更精确地鉴定微生物种类,甚至在一些情况下能达到属或种的级别。

避免偏见:16S rRNA基因测序依赖于特定的引物来扩增微生物基因组中的一小段区域,这可能导致某些微生物被过度表示或者被忽略。宏基因组测序由于不依赖于特定的引物,因此可以减少这种偏见。

新物种的发现:由于宏基因组测序能够检测到未知的基因序列,它有助于发现新的微生物物种和遗传元素,这在传统的16S rRNA基因测序中是困难的。

总的来说,宏基因组测序提供了一个更全面、深入和精确的了解微生物群落的方式,特别是在功能层面上,这对于理解微生物与植物之间的复杂相互作用尤为重要。(内容是对于:宏基因组测序与16S rRNA基因测序技术之间的优势对比)




应用领域

 



  • 探究不同环境或生理状态下的菌群组成及差异变化

  • 作为疾病诊断、预后和个性化治疗的新型生物标志物(biomarker)

  • 微生物在病理或生理中的功能机制研究




分析内容

 



服务介绍




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