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数据全面提升—2025年单细胞转录组测序王炸新品-GEM-X

单细胞技术的革新正在突破生命科学研究的认知边界。传统Bulk测序将细胞群体简化为均质化样本,模糊了细胞异质性带来的生物学意义。以10x Genomics为代表的单细胞技术平台的出现,使科学家能够在分子层面对单个细胞进行“显微解剖”,解释组织微环境、发育轨迹和疾病状态的复杂景观。


近年来,单细胞技术持续迭代,依托微流控技术革新与人工智能算法突破,研究范式正从定性解析迈向动态全景分析。10x Genomics推出的GEM-X单细胞解决方案,以性能破界助力科学家对生命最小单元发起更深层次的对话。


图1. Chromium X仪器以及GEM-X single Cell 单细胞3’试剂套装V4



全面升级



目前欧易生物正式提供GEM-X 3’单细胞转录组解决方案,升级的试剂搭载于Chromium X系列仪器,在原有版本的基础上进行了参数的全面升级,其核心优势包括:


1. 微流控芯片升级:油包水(GEM)的形成将更加快速、稳定。运行时间从18分钟缩短至6分钟,大幅降低脆弱细胞(如中性粒细胞)的机械应激损伤。


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图2. GEM-X下机数据里中性细胞捕获效果显著提升


2. 数据质量突破:相同测序深度下,单个细胞的基因检测数量提升50-80%,低丰度基因的捕获灵敏度也有显著增强。


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图3. 不同组织V3.1以及GEM-X(V4)基因中位值对比


3. 通量翻倍与效率跃升:每个通道能够捕获的细胞数量相较V3.1进行了翻倍,目前每个通道最多可以捕获20000个细胞。在提高通量的同时,捕获效率也迎来了提升。


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图4. V3.1以及GEM-X(V4)细胞捕获效率对比


4. 多胞率下降:在单细胞检测中,数量稀少但关键的细胞群体的捕获一直是一个难题,如果要检出此类细胞,捕获效率、通量以及多胞率三个指标都要做到质变。GEM-X的多胞率相较于V3.1,有着百分之五十的下降,极大增加了捕获稀少细胞类型的机率。

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图5. V3.1以及GEM-X(V4)多胞率对比


欧易生物实测数据展示:

样本名称

捕获细胞数

基因中位值

UMI中位值

小鼠脑

17xxx

19xx

40xx

小鼠棕色脂肪

18xxx

22xx

49xx

小鼠脑

14xxx

30xx

69xx

小鼠耳蜗

12xxx

22xx

38xx

小鼠心脏

11xxx

29xx

74xx

人胃癌活检

12xxx

23xx

68xx

人肝癌

14xxx

22xx

46xx

人肝癌

15xxx

23xx

49xx

人肠道

15xxx

28xx

64xx


欧易生物目前已开启GEM-X 单细胞3转录组解决方案订购,邀请各位科学家一起向单细胞新时代发起挑战。

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