单细胞转录组测序
10× Genomics的Chromium系统
利用8通道的微流体“双十字”交叉系统,将含barcode的凝胶珠(Gel Beads)、细胞和酶的混合物、油三者混合,形成GEMs(油包水的微体系),GEMs形成后,细胞裂解,凝胶珠自动溶解释放大量barcode序列,随后mRNA逆转录产生带有10× barcode和UMI信息的cDNA,构建标准测序文库。
BD单细胞分选平台
利用微孔技术,在微孔中一个细胞与一个barcode标记的磁珠匹配,细胞裂解,mRNA被磁珠上的barcode序列捕获, 然后将捕获了mRNA的磁珠进行回收,并完成cDNA合成、建库和测序,最后通过数据分析,根据barcode序列来区分不同细胞的mRNA序列。
技术优势
10x单细胞转录组测序
通量高:一次可以同时测8个样本,每个样本最多可以检测到上万个细胞
周期短:17分钟内完成上万个细胞封装,一天之内完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增以及建库
捕获效率高:细胞捕获效率高达65 %
应用范围广:动物细胞和植物细胞均可以进行单细胞测序,已广泛应用于肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测和胚胎发育研究等
BD单细胞转录组测序
活性要求低:细胞活率达到60%即可上机,解决特殊样本上机难的问题
多样本混合:Sample Tag技术联合20W+微孔,可同时处理多个样本
捕获效率高:蜂窝板技术避免概率碰撞,提升捕获效率高达79%
成像系统:可通过屏幕进行细胞质控实时监控,观察细胞相关信息
panel靶向:可以靶向观察目标基因,适用于低丰度基因
分析结果展示