「10x FLEX石蜡样本单细胞转录组」
10x Genomics Single Cell Gene Expression FLEX单细胞转录组测序技术(以下简称FLEX),采用4%的多聚甲醛(PFA)对细胞进行固定,一步锁定RNA表达状态,解决了样本储存、多样本批次处理、多时间点多组样本的混样等问题,同时解锁FFPE样本的单细胞转录组测序。
图 | 10x FLEX流程(来源:10x Genomics)
有别于新鲜解离单细胞转录组测序基于polyA捕获的方法,RNA固定处理的样本或FFPE样本采用的是利用探针杂交捕获基因的方法,探针组作用包括检测基因表达与提供分组信息。
FLEX配套的杂交探针包括LHS和RHS类似左右2个抓手,可增强杂交的特异性,RHS上包含区分样本来源的ProbeBarcode,每个样本与不同的探针进行杂交,数据分析时可通过识别不同的Barcode将不同样本来源的Read区分开。FLEX配套芯片有8个通道,单个通道可以混合4个样本。由于探针具有物种特异性,目前FLEX方案仅可应用于人和小鼠样本。
图 | 探针杂交示意图(来源:10x Genomics)
「技术优势」
操作步骤更加简单易行
仅需多聚甲醛固定,操作简单,改进样本采集、制备和处理流程
样本采集更加灵活
固定样本生物学状态,便于样本存储运输,将样本采集扩展到多个采集点的样本,缓解单细胞样本采集的限制
打破脆弱样本、珍贵样本的限制
锁定脆弱细胞或快速变化细胞生物学状态,将实验范围扩展到脆弱或濒死细胞、状态可能不断变化以及珍贵细胞
优于或与常规单细胞转录组相当的分析结果
数据表现优良,关键有效数据量、基因表达量、分群结果与常规单细胞表现一致,且可提高低表达基因的检出率
百万级细胞的高通量,混样降低实验成本
单通道中最多可混16个样品,单张芯片最多可混128个样本,最多可得1,024,000个细胞,混样降低实验成本
减少生产试验的批次效应
样本固定后集中处理,在同一次运行中批量操作实验和分析,最大限度减少实验可变性
「欧易生物优势」
成果转化行业前列:以文章产出为导向,时空多组学(单细胞转录组+空间转录组+空间代谢组)帮助客户转化文章300+篇(行业前列)、近190篇致谢文章(行业前列)、作者署名15篇(行业前列)
经验丰富:欧易生物是行业内首批开展高通量单细胞转录组的公司,累计完成2000+项目和20,000+例标本悬液制备和测序,样本类型覆盖400+组织与60+植物样本
实验质控严格:
针对于客户样本,对除了活性以外的碎片率、结团和细胞状态等做充分评估,保证数据质量;
服务客户的使命必达:售后问题不推脱,解决迅速
提供「团队式」售后处理模式:
团队中技术支持作为项目主导,及时跟进项目,提供以下(但不限于)项目支持工作,包括分析内容解读,相关问题答疑,结果讨论,下一步工作计划,文章思路讨论,文章撰写建议等;
团队中销售主要跟进产出,提供结果交付,项目会议协调等工作;
团队中生信工程师提供单细胞相关标准分析、高级分析、个性化分析等内容的输出。
「团队式」售后处理模式项目跟进速度快:可随时联系到技术支持和分析人员,不额外设定分析次数(避免了分析超额多收费的现象),提供个性化分析内容
「分析内容」