10x Genomics FLEX单细胞转录组测序
单细胞水平对转录组进行测序可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。10 X Genomics单细胞转录组测序平台利用微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术来实现高通量的细胞捕获技术,能够一次性分离、并标记500–10000个单细胞,从而获得每个细胞的3’端的转录组信息。具有细胞通量高、建库成本低、捕获周期短等优势,但存在仅限于新鲜样本务必及时处理,可能导致样本批次差异的问题。
10x Genomics Single Cell Gene Expression FLEX单细胞转录组测序技术(以下简称FLEX),采用4%的多聚甲醛(PFA)对细胞进行固定,一步锁定RNA表达状态, 解决了样本储存、多样本批次处理的问题,同时解锁FFPE样本的单细胞转录组测序功能。该技术不仅可用于样本固定,更配备有实惠的混样测序整体解决方案。
技术优势
• 操作步骤更加简单易行
仅需多聚甲醛固定,操作简单,改进样本采集、制备和处理流程
• 样本采集更加灵活
固定样本生物学状态,便于样本存储运输,将样本采集扩展到多个采集点的样本,缓解单细胞样本采集的限制
• 打破脆弱样本、珍贵样本的限制
锁定脆弱细胞或快速变化细胞生物学状态,将实验范围扩展到脆弱或濒死细胞、状态可能不断变化以及珍贵细胞
• 优于或与常规单细胞转录组相当的分析结果
数据表现优良,关键有效数据量、基因表达量、分群结果与常规单细胞表现一致,且可提高低表达基因的检出率
• 百万级细胞的高通量,混样降低实验成本
单通道中最多可混16个样品,单张芯片最多可混128个样本,最多可得1,024,000个细胞,混样降低实验成本
• 减少生产试验的批次效应
样本固定后集中处理,在同一次运行中批量操作实验和分析,最大限度减少实验可变性
样本要求
样品类型 | 样本量 | 运输条件 | 运输时限 |
新鲜血液 | ≥4mL | 冰袋运输 | 8小时内送达 |
新鲜组织 | 0.2-1g | 放入组织保存液,4℃保存,冰袋运输 | 48小时内送达 |
FFPE样本 | 4x 25μm(人)或 | 冰袋运输 | 3日内送达 |
4×50μm(小鼠) | |||
液氮速冻样本 | 0.2-1g | 干冰运输 | 72小时内送达 |