FLEX单细胞转录组测序


10x Genomics FLEX单细胞转录组测序


单细胞水平对转录组进行测序可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。10 X Genomics单细胞转录组测序平台利用微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术来实现高通量的细胞捕获技术,能够一次性分离、并标记500–10000个单细胞,从而获得每个细胞的3’端的转录组信息。具有细胞通量高、建库成本低、捕获周期短等优势,但存在仅限于新鲜样本务必及时处理,可能导致样本批次差异的问题。


10x Genomics Single Cell Gene Expression FLEX单细胞转录组测序技术(以下简称FLEX),采用4%的多聚甲醛(PFA)对细胞进行固定,一步锁定RNA表达状态, 解决了样本储存、多样本批次处理的问题,同时解锁FFPE样本的单细胞转录组测序功能。该技术不仅可用于样本固定,更配备有实惠的混样测序整体解决方案。





技术优势


操作步骤更加简单易行

仅需多聚甲醛固定,操作简单,改进样本采集、制备和处理流程


• 样本采集更加灵活

固定样本生物学状态,便于样本存储运输,将样本采集扩展到多个采集点的样本,缓解单细胞样本采集的限制


• 打破脆弱样本、珍贵样本的限制

锁定脆弱细胞或快速变化细胞生物学状态,将实验范围扩展到脆弱或濒死细胞、状态可能不断变化以及珍贵细胞


• 优于或与常规单细胞转录组相当的分析结果

数据表现优良,关键有效数据量、基因表达量、分群结果与常规单细胞表现一致,且可提高低表达基因的检出率


• 百万级细胞的高通量,混样降低实验成本

单通道中最多可混16个样品,单张芯片最多可混128个样本,最多可得1,024,000个细胞,混样降低实验成本


• 减少生产试验的批次效应

样本固定后集中处理,在同一次运行中批量操作实验和分析,最大限度减少实验可变性




样本要求


样品类型样本量运输条件运输时限
新鲜血液≥4mL冰袋运输8小时内送达
新鲜组织0.2-1g放入组织保存液,4℃保存,冰袋运输48小时内送达
FFPE样本4x 25μm(人)或冰袋运输3日内送达
4×50μm(小鼠)
液氮速冻样本0.2-1g干冰运输72小时内送达




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