10x Genomics Xenium组织空间原位分析技术
空间组学技术能够获取组织切片上不同位置细胞中的转录组数据，解析转录本在组织的不同空间位置的表达特征。目前10x Genomics的Visium技术是较为主流的商业化空间转录组技术，其发文量也最多。但是 Visium技术的局限性在于检测分辨率不是真正意义上的单细胞水平，而是检测芯片上单个spot（55um，通常包含5-10个细胞）中的基因表达的信息。
随着研究热度的持续高涨，针对空间组学研究的技术和仪器近年来也在不断推陈出新，这进一步促进了研究的发展。欧易生物持续关注最前沿技术进展，在此重磅推出空间组学研究最新解决方案——Xenium单细胞/亚细胞空间原位分析技术！与Visium相比，该技术在很大程度上提高了空间上的分辨率，能够原位捕获RNA及蛋白分子在单细胞/亚细胞水平的表达信息。
技术优势
高灵敏性、高特异性：独特的挂锁式探针设计，增强了检测的灵敏性和特异性
高分辨率：结合原位显微成像的方法，实现亚细胞水平的原位基因表达分析，大大提高了空间组学分辨率
高通量：Xenium载玻片的成像区域大小为12mm x 24mm，一次上机可并行检测两张玻片；满足横截面较大组织研究需求的同时，也可以在一张玻片上检测多张组织切片（2-3张）
高灵活性：多种预制Panel可选，也可添加定制1-100个靶基因，满足特定研究的个性化需求
高样本兼容性：能够识别短或高度降解的转录本，可兼容新鲜冷冻样本(FF)，福尔马林固定石蜡包埋样本(FFPE)及组织矩阵样品(TMA)等各类常见临床转化样品类型
非破坏性：Xenium的非破坏性分析能够在运行后保持组织形态完整性，可在同一张新鲜冷冻或FFPE切片上获得RNA、IF和形态学（H&E）信息，与组织病理学研究无缝整合
技术比较
| 10x visium | 10x xenium | |
| 技术原理 | 结合显微HE成像和测序技术，基于polyA捕获mRNA | 原位显微成像，基于带有荧光序列的探针捕获mRNA |
| 检测基因数 | 不需要先验知识可以进行无偏的转录本检测（~2万） | 检测靶RNA的信息（~500） |
| 分辨率 | 空间分辨率是100微米，不能达到单细胞的水平 | 光学分辨率是 0.2 微米，分辨率可以精确到单个细胞水平 |
| 组织兼容 | 都兼容新鲜冷冻组织（FF）和石蜡包埋组织（FFPE） | |
| 是否需要单细胞数据 | 需要结合单细胞（提供单细胞分辨率） | 建议结合单细胞（提供基因检测通量） |
样本要求
| 样本类型 | 样本准备（仅限人和小鼠样本） | 运送条件 |
| 石蜡块 | 常规石蜡包埋方法，保存年限不超过5年，固定时长不超过24小时 | 务必固定在石蜡的包埋盒内，多个石蜡块为防止相互磕碰，需要独立包装，可采用气泡膜、锡纸、玻片盒等保护方式，最终放入一大塑料袋中统一冰袋寄送 |
| OCT冰冻包埋样本 | 同空间转录组新鲜冰冻样本的包埋方式，采用干冰速冻 | 埋没在干冰中，干冰量根据每天 4 公斤来计算，使用厚实的泡沫箱寄送 |
| 小贴士：正式实验前我们会通过RNA抽提，切片HE染色确认样本质量。（详见Xenium 组织空间原位分析技术 样本准备指南） | ||
