蛋白质谱鉴定技术以质谱技术为核心，通过自下而上的蛋白质组学（Bottom-up proteomics ）方法鉴定样本中的蛋白 质种类。该技术集样品特殊处理、质谱鉴定和数据分析于一体，具有高通量、高灵敏度的特点，是当前大规模蛋白质研 究的主要技术。

技术流程

服务优势

实验流程简便高效：实验流程简便高效 ，减少蛋白损失

项目周期短：15个工作日即可提供完整报告

应用方向

构建蛋白质组数据库

蛋白互作研究

蛋白调控研究

研究案例

Pancreatic cancer risk variant in LINC00673 creates a miR-1231 binding site and interferes with PTPN11  degradation 

长链非编码 RNA-LINC00673 中的一个胰腺癌风险变异为 miR-1231构建了结合位点使得 PTPN11 降解受到干扰

发表期刊：Nature genetics  | 影响因子：41.307  | 实验材料：细胞系、小鼠、人胰腺组织、血 

主要技术：GWAS、qRT–PCR、immunoprecipitation、LC-MSMS 蛋白鉴定（欧易生物提供服务支持）

研究背景

在过去十年中，发表了 1,300 多个全基因组关联研究（GWAS），确定了近 6,500 个与疾病或性状相关的基因位点。然而， 只有 7％的基因位点位于蛋白质编码区，而 93％位于非编码区。蛋白质编码区域的突变通常是非常有害或致命的，因此 癌症发展之前这类突变的携带者可能不会存活；然而，调节区域的突变能以细胞类型或组织特异性方式引起基因表达 的细微变化，这可能会导致载体对癌症的易感性。LincRNA 是非编码转录本，长度超过 200 nt，为人类非编码转录组 中最大的亚类。越来越多的证据表明 lincRNA 参与了广泛的细胞过程，其中有研究表明 lincRNA 在许多人类疾病（包 括癌症）中有异常表达且发挥功能。因此，这类基因位点的发现及其生物学功能的阐明有助于理解癌症的病因、促进癌 症筛查及开发新治疗方法。本研究在中国人群中鉴定到了 LINC00673 中 rs11655237 的突变是胰腺导管腺癌（pancreatic  ductal adenocarcinoma , PDAC）易感因素。

结果展示

研究结论

• 通过 GWAS 分析发现了位于 17q24.3 的 LINC00673 与 PDAC 风险相关。 

• 证明 LINC00673 可以与 PTPN11 相互作用并促进 PTPN11 泛素化。 

• 发现 miR-1231 可以靶向由 rs116552337 G> A 突变产生的 LINC00673 变体，导致细胞中游离 LINC00673 的水平 降低。LINC00673 在细胞中的异常表达可导致高水平的 PTPN11，从而触发 SRC-ERK 致癌信号传导，同时减弱 STAT1 依赖性抗原信号传导。