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单细胞数据「秀肌肉」——钻石级服务商如何为客户提供「硬数据」



单细胞转录组测序技术指在单个细胞水平上对转录信息进行提取以及高通量测序,借助此优势能够对组织的异质性进行深度的解析。随着单细胞检测领域中技术的优化以及拓展,在组织发育肿瘤免疫以及植物领域都有较为广泛的应用场景。


就目前而言,单细胞转录组检测主要依赖于两种技术手段,一种为液滴法,另外一种为微孔板。液滴法的代表性平台为10x Genomics于2015年推出的Chromium 单细胞测序平台,其优异的科研表现以及技术优势使其成为了单细胞检测领域的标杆公司。但近年来,国产单细胞平台的崛起同样不同小觑,其中墨卓生物推出的MobiNova®单细胞解决方案在数据性能以及效益上都能够和国际主流平台齐平,有利于推动国内大规模的单细胞研究。

墨卓生物推出的单细胞技术平台与10x Genomics相同,都是基于液滴法发展而来,这种技术的优势就在于能够将每一个液滴变为一个体系,从而进行大规模、高通量的检测。

自2022年起,欧易生物与墨卓生物开展合作以来,经过两年的共同努力,积累了丰富的项目经验,成功完成了超过5000例样本的检测,涵盖了20多个物种以及多种器官类型。2024年,欧易生物荣获墨卓生物颁发的唯一钻石级战略合作伙伴认证点击回顾。通过两年的经验积累,小编整理了人和小鼠多种组织的实测数据。接下来,让我们一同来看看墨卓单细胞检测平台的出色表现。




说明:图片源自墨卓生物官方




墨卓单细胞/核转录组实测数据展示













总体来看,在100g的测序量下,不同组织类型下的高质量细胞数大多稳定在1万1.5万之间,测序饱和度则保持在30%60%左右。此外,所有样本的基因中位值都达到了1000,而对于个别组织,例如膀胱癌样本,这一数值甚至能够突破3000,达到3500


图1 | 人、小鼠不同组织类型基因中位值展示










图2 | 人、小鼠不同组织类型测序饱和度展示










图3 | 人、小鼠不同组织类型捕获细胞数展示



2023-2024年度欧易生物&墨卓单细胞平台客户文章














表1 | 2023-2024年度欧易生物&墨卓单细胞平台客户文章



结语













经过两年的检验,墨卓的单细胞转录组检测平台已经得到了充分的验证,其指标、性能都不亚于国际主流的单细胞测序平台。同等表现下,墨卓能够以更低的成本为科学研究提供可靠的支持。


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