10x Visium CytAssist(冰冻/FFPE样本)空间转录组测序



「10x Visium CytAssist(冰冻/FFPE样本)空间转录组测序





在VisiumCytAssist工作流程中,在普通玻片上进行的是FFPE组织切片的脱蜡、染色、成像、解交联和探针杂交。探针杂交采用RNA模板连接机制,针对特定基因,设计成对探针与其靶标杂交,然后彼此连接。之后,将两个普通玻片和一张含有2个捕获区域(6.5mm×6.5mm或11mm×11mm)的Visium建库芯片放入Visium CytAssist仪器中,使普通玻片上的组织切片与2个Visium捕获区域对齐。组织被渗透后,释放连接的探针对,结合捕获载玻片上的探针,以此捕获基因表达信息。

目前,VisiumCytAssist可以支持对人类和小鼠FFPE样本中超过18,000个基因的RNA表达进行空间分析,并在整个组织切片上具有高分辨率。

此外,现在OCT冰冻样本也可以通过CytAssist来实验,原理基于同样的探针杂交。CytAssist已实现在同平台FFPE样本和冰冻样本空间转录组的探索。


服务介绍


图 | 基于Visium CytAssist的FFPE工作流程(来源/10x Genomics)





「技术优势




解锁更多样本类型:您可以把标准载玻片上的预切片组织、存档的盖玻片样本或新切切片中的分析物转移到Visium空间玻片上,进一步扩展了兼容的样本类型


解决选片困扰:之前选择哪一张切片进行空间分析一直是大家觉得有挑战的地方,有了CytAssist,您可以通过H&E或免疫荧光染色确定要分析的正确切片,然后再用CytAssist进行分析物转移,极大的避免了之前的风险,能够准确地选择想要使用Visium分析的切片


更灵活的样本准备:只需准备两样本即可上机(只有两个捕获区域),捕获面积上可以选择使用6.5x6.5mm或11x11mm(后续推出)两种尺寸


质控更友好:质控标准为DV200大于40%,可检测的FFPE样本更多


上机前步骤优化:更高组织粘附性,不要再做预实验的脱片测试





「欧易生物优势




成果转化行业前列:以文章产出为导向,时空多组学(单细胞转录组+空间转录组+空间代谢组)帮助客户转化文章300+篇(行业前列)、近190篇致谢文章(行业前列)、作者署名15篇(行业前列


经验丰富:欧易是行业第一梯度开展高通量单细胞转录组和空间转录组的公司,空间转录组累计完成1000+项目,已完成切片的冰冻样本1500+、FFPE样本200+、样本类型50+


实验质控严格:针对于客户样本,对除了活性以外的碎片率、结团和细胞状态等做充分评估,保证数据质量


服务客户的使命必达:售后问题不推脱,解决迅速


欧易提供「团队式」的售后处理模式

  • 团队中技术支持作为项目主导,及时跟进项目,提供以下(但不限于)项目支持工作,包括分析内容解读,相关问题答疑,结果讨论,下一步工作计划,文章思路讨论,文章撰写建议等

  • 团队中销售主要跟进产出,提供结果交付,项目会议协调等工作

  • 团队中生信工程师提供单细胞相关标准分析、高级分析、个性化分析等内容的输出


「团队式」的售后处理模式项目跟进速度快:可随时联系到技术支持和分析人员,不额外设定分析次数(避免了分析超额多收费的现象),提供个性化分析内容(不会某些分析做不了或者不愿意尝试)


空转多组学联合转化行业第一

  • 欧易生物是较早转化空转+空代多组学的公司(NC)

  • 欧易生物也是较早同时转化单细胞+空转+空代的公司(NCB)

  • 空转整体发文量行业前3




「分析内容




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