10x单细胞多组学ATAC+基因表达



10x单细胞多组学ATAC+基因表达



多组学方法可帮助科研人员从单个细胞中获取更多信息,从而改变人们对生物学的理解,并发现隐藏的线索。10x Genomics单细胞多组学ATAC +基因表达以数千个细胞为研究对象,同时分析同一细胞中的基因表达和开放染色质。

该方法可以构建细胞的基因表达谱及其表观基因组图谱的一体化视图。同时采用两种模式,能够提高细胞状态的分辨率,鉴定差异基因表达的驱动因素,并发现转录谱相似但染色质谱在功能上不同的细胞。实现了同一单细胞的多组学分析,有助于了解肿瘤异质性的驱动因素、治疗耐药的机制以及与神经退行性或免疫性疾病相关的细胞类型。


亮点


  • 采用鉴定开放染色质区域的染色质转座酶可接近性分析(ATAC)以及RNA-seq,将表观基因组和基因表达分析相结合,大大提升科研人员的探索能力

  • 通过转录和表观基因组的关联分析来加深研究人员对细胞类型和状态的鉴定

  • 发现新的基因调控相互作用

  • 使用关键的表达标志物来轻松解释表观遗传图谱

  • 通过同一细胞的多个读数,从宝贵样本中获得最大量的信息





技术特色


在每个通道中高效分配500-10,000个细胞核,每次运行最多可分析80,000个细胞核

可扩展;最多可平行运行8个样本

细胞核回收率高达65%

高灵敏度

微流体双重率低(每1,000个细胞核低于1%)

经过细胞系、原代细胞、冷冻保存样本以及新鲜和冻存组织的验证






应用


生物标志物发现

细胞谱系和发育程序追踪

细胞异质性以及稀有细胞群体的检测

基因调控网络

对治疗干预的反应



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