多年来，欧易生物深耕于生命科学科研服务行业，致力于为生命科学领域的科学家和研发人员提供靠谱的创新多组学技术服务。欧易生物在单细胞与空间多组学、传统转录组学、基因组学、蛋白代谢组学及微生物组学等方向积累了深厚经验，打造了成熟的多组学一站式服务平台。迄今为止，我们已助力客户在高端国际期刊上发表了大量文章。
据不完全统计，2024年12月欧易生物助力130篇客户文章发表在各领域知名期刊上，累计IF高达926.1分，平均IF达到7.1分。其中包Molecular Cancer，ADVANCED MATERIALS，Cancer Communications等在内的影响因子10分以上文章34篇。此次收录的文章涵盖多个研究方向，如涉及单细胞时空组学方向6篇、转录调控方向60篇、基因组方向5篇、表观方向2篇、微生物方向19篇、蛋白组&代谢组18篇、云平台14篇、多组学联合6篇。
接下来让我们一起回顾一下最新的科研成果！
Molecular Cancer |基于多种翻译后修饰的谱系功能相关的调控模式及其在人肝细胞癌中的治疗机遇
影响因子：27.7
作者单位：安徽医科大学第一附属医院
研究内容：翻译后修饰（PTMs）在肝细胞癌（HCC）中起着关键作用。然而，PTM修饰位点在HCC的蛋白二级结构和调控模式中的位置在很大程度上仍未被确定。通过4D无标记蛋白质组学分析结合基于翻译后修饰（PTM）的肽段富集技术，系统分析了来自18例肝细胞癌（HCC）患者的肿瘤组织和配对的邻近正常组织中的全蛋白组以及九种翻译后修饰（磷酸化、乙酰化、巴豆酰化、泛素化、乳酸化、N-糖基化、琥珀酰化、丙二酰化和β-羟基丁酰化）。研究者们检测到具有磷酸化位点的内在无序蛋白区域（IDRs）位置的稳健偏好，以及其他位于折叠区域的位点偏差。综合分析显示，磷酸化和多个酰化修饰位点在含有RRM1结构域的蛋白质中富集，RNA剪接是该蛋白质子集的关键特征，通过剪接因子NCL在多个残基上的磷酸化和酰化表明。研究者们认为NCL-S67、K398和K646协同调控RNA加工。总之，这种蛋白质组分析代表了一个全面的研究，详细描述了基于多个HCC的PTMs的调控模式。
ADVANCED MATERIALS | 功能化纳米酶微胶囊通过线粒体稳态重构预防耳聋
研究内容：线粒体功能障碍是顺铂诱导听力损失的主要机制，但通过调节氧化还原平衡和重新编程能量代谢以重塑线粒体稳态，可能缓解这种损伤。在本研究中，研究者们采用乙酰半胱氨酸（N-acetyl-l-cysteine, NAC）衍生的碳化聚合物点（NAC CPDs），将其嵌入锰卟啉掺杂的金属有机框架中，并用聚多巴胺（PDA）涂层和甲基丙烯酰基明胶（GelMA）水凝胶包裹，制备功能化纳米酶微胶囊。由于其可注射性和良好的粘附性能，这些微胶囊在中耳中具有延长滞留时间的优势，并能够在内耳中实现持续释放。锰卟啉与聚合物点之间的协同作用赋予了纳米酶优异的抗氧化性能。该研究所研发的纳米酶通过激活PI3K-AKT通路，重新编程能量供应机制，并抑制线粒体中BAX的寡聚化，从而防止线粒体DNA和细胞色素c的泄漏。通过体内实验证实了其治疗效果及相关机制。因此，本研究通过纳米酶微胶囊对线粒体稳态的重塑，为听力损失的治疗开辟了新的篇章。
Cancer Communications | 肝脏转移微环境中通过EPHB1-EFNB1轴的肿瘤-血小板相互作用促进胰腺导管腺癌转移性肿瘤的扩展
影响因子：20.1
作者单位：上海交通大学医学院附属仁济医院
涉及的欧易生物服务产品：转录组测序
ADVANCED FUNCTIONAL MATERIALS | 一种增强干性眼药水通过持续释放Versican蛋白并提供润滑基底，刺激角膜再生
ADVANCED FUNCTIONAL MATERIALS | 一种骨靶向硫化氢递送系统，通过巨噬细胞重编程和成骨细胞-破骨细胞耦合作用治疗骨质疏松性骨折
ACS Nano | 仿生“Trojan Horse”纤维调节先天免疫级联反应以促进神经再生
研究内容：中性粒细胞膜囊泡（NMVs）已被成功应用于通过充当炎症因子诱饵来控制脊髓损伤（SCI）后的炎症级联反应，从而提前调控整体炎症的调节窗口。然而，NMVs如何调节巨噬细胞表型转变及其结果的机制很少被报道。本研究展示了NMVs被巨噬细胞内吞后的“吞噬效应”，通过促进谷氨酰胺代谢补充三羧酸循环中间代谢物α-KG(α-酮戊二酸)，进而促进氧化磷酸化并抑制NF-κB信号通路，重新编程炎症性巨噬细胞为促再生表型。基于这些发现，研究者们构建了一种“Trojan Horse”复合纤维支架，该支架由带有羧基的聚L-乳酸壳包裹NMVs，核心部分装载有脑源性神经营养因子，对炎症微环境的时空调节率为39.23%，可持续促进神经再生率为85.67%。体内实验进一步验证了NMV包覆纤维支架在调控早期先天免疫炎症和持续促进神经再生方面的作用。本研究不仅进一步揭示了中性粒细胞膜和巨噬细胞相互作用的机制，还为协调炎症重编程和脊髓损伤后神经再生提供了新的策略。
ACS Nano | 通过反应诱导自组装的动态共价前药纳米网络用于牙周炎治疗
Nature Communications | GPR156在维持听力功能中的激活机制
Nature Communications | SCM-198通过选择性靶向AdipoR2-CaM-CaMKII-NOS3轴以快速作用治疗急性肝衰竭晚期
研究内容：急性肝衰竭（ALF）是一种肝脏急症，表现为肝脏快速破坏、多脏器衰竭和高死亡率。尽管经过数十年的研究，但对于已建立的ALF，现有的治疗方案仍然十分有限。本研究发现，生物活性小分子化合物SCM-198能够在ALF建立后24小时内将雄性ALF小鼠的生存率提高到100%。研究发现脂联素受体2（AdipoR2）是SCM-198的选择性靶点，其中AdipoR2的R335残基对SCM-198-AdipoR2的结合和信号传导至关重要，而AdipoR2的Y274残基则充当钙离子（Ca²⁺）流入的分子开关。SCM-198与AdipoR2结合引发Ca²⁺流入，并提高了CaMKII和NOS3的磷酸化水平，这一过程通过AdipoR2-CaM-CaMKII-NOS3复合物迅速诱导一氧化氮（NO）的生成，从而为小鼠ALF提供肝脏保护。SCM-198还能够保护人类胚胎干细胞（ESC）来源的肝脏类器官免受APAP/TAA损伤。因此，SCM-198通过选择性靶向AdipoR2-CaM-CaMKII-NOS3轴，提供了一种针对晚期ALF的快速作用治疗策略。
Acta Pharmaceutica Sinica B | 纳米工程化载体通过靶向体内Foxo3基因编辑调节软骨细胞的线粒体自噬，以缓解骨关节炎
研究内容：软骨细胞的线粒体功能障碍是骨关节炎（OA）中的关键致病因素，但在体内直接调节线粒体仍然是一个重大挑战。本研究首次验证了OA患者软骨中线粒体功能障碍与FOXO3基因下调之间的相关性，突出了通过调节FoxO3基因来调控线粒体自噬，从而缓解OA的潜力。因此，研究者开发了一种靶向软骨细胞的CRISPR/Cas9基因编辑工具（FoxO3），并将其整合到纳米工程化的“载体”中（NETT, FoxO3--NETT）。随后，这一工具被包裹在可注射的水凝胶微球（FoxO3-NETT@SMs）中，以利用海藻酸钠的抗氧化特性和混合外泌体的增强润滑效果。总体而言，这些FoxO3-NETT@SMs成功激活线粒体自噬，并通过FoxO3基因调控的PINK1/Parkin通路重新平衡OA软骨细胞的线粒体功能。因此，FoxO3-NETT@SMs在体外刺激了软骨细胞的增殖、迁移和细胞外基质（ECM）产生，并有效缓解了体内OA的进展，展示了其在临床应用中的巨大潜力。
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