项目文章

Phytomedicine|浙江中医药大学袁小凤团队揭示葛根素靶向 CaMKIIδ 阻断 DLG4-Ser654 磷酸化缓解脑缺血再灌注损伤



 研 究 背 景 


缺血性脑卒中再通后,相当一部分患者仍因继发性脑缺血再灌注(I/R)损伤遗留持续神经功能缺损,其核心病理环节之一是突触结构崩解与随之发生的神经元凋亡。病理性 Ca²⁺超载可驱动突触支架蛋白 DLG4(PSD-95)异常磷酸化,触发 DLG4–AMPA 复合体解离与突触失效;然而,将 Ca²⁺信号转化为 DLG4 异常磷酸化的具体激酶通路——DLG4 究竟被何种激酶、在哪个位点直接磷酸化——长期不清。葛根素虽在实验性缺血模型中显示神经保护,但其能否直接靶向该突触激酶以阻止磷酸化依赖的 PSD 失稳,尚待阐明。

2026年3月,浙江中医药大学袁小凤团队在 Phytomedicine(IF 11.3)发表研究,通过整合DIA蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学与激酶–底物富集分析(KSEA),锁定 CaMKIIδ 经 Thr287 自磷酸化异常激活为 I/R 损伤海马的关键致病介质;并筛选发现葛根素为 CaMKIIδ 候选抑制剂,证实其锚定 ATP 结合口袋、直接抑制激酶活性。进一步发现,突触支架 DLG4 的 Ser654 是 CaMKIIδ 此前未知的直接磷酸化位点,其病理性磷酸化导致 AMPA 受体解离与神经元凋亡。葛根素在 PC-12 兴奋性毒性模型与 MCAO (脑缺血再灌注损伤动物模型)大鼠模型中均可抑制 CaMKIIδ 激活、阻断 DLG4-Ser654 磷酸化、恢复突触稳定性并减轻梗死与神经缺损;该效应被 CaMKIIδ 沉默或特异性抑制剂 KN-93 严格封阻(occlusion),证实其为 on-target 效应。该研究首次阐明 CaMKIIδ–DLG4–AMPAR 病理级联,并将葛根素确立为结构导向的 CaMKIIδ 天然抑制剂候选

【欧易生物为本研究提供DIA蛋白质组学与磷酸化修饰蛋白质组学技术服务】


PixPin_2026-08-24_15-48-07.png


 研 究 思 路 
 




 研 究 结 果 


1. 整合多组学分析锁定异常的 CaMKIIδ-Thr287 磷酸化是脑缺血再灌注损伤的关键驱动因素

为了全面阐明脑I/R损伤的分子病理机制并识别潜在的干预靶点,研究团队对假对照组和缺血/再灌注损伤(模型组)大鼠的海马组织开展 DIA蛋白质组学与磷酸化修饰蛋白质组学,并进行联合分析。

PCA 图显示两组样本明显分离;火山图结果表明,磷酸化层面的改变(2683 个差异位点)在数量与幅度上都远超蛋白丰度改变(991 个差异蛋白),提示磷酸化紊乱是 I/R 早期的突出特征。GO/KEGG 富集分析显示,差异磷酸化蛋白主要富集于突触密度、谷氨酸能突触与钙信号通路。KSEA 进一步显示 CaMKII 家族激活信号最强,其中 CaMKIIδ(CAMK2D)的标准化富集分数(NES)最高。对 CaMKII 四个亚型的总蛋白与自磷酸化位点进行比较后发现:各亚型总蛋白水平均无显著差异,仅 CaMKIIδ 自抑制区Thr287 位点特异性上调,而 CaMKIIα Thr286 未被检出、其余亚型亦无明显变化。综上,I/R 并不改变 CaMKII 总蛋白丰度,而是特异性诱导 CaMKIIδ-Thr287 过度自磷酸化并持续活化,提示 CaMKIIδ 是 I/R 损伤的核心驱动靶点。


图1. 蛋白质组学与磷酸化蛋白质组学联合分析显示 I/R 海马磷酸化紊乱显著,CaMKIIδ 经 Thr287 自磷酸化异常激活


2. 集成深度学习虚拟筛选将葛根素锁定为 CaMKIIδ 潜在抑制剂

为从天然产物中发掘 CaMKIIδ 抑制剂,作者构建了集成深度学习筛选模型(CNN + RF + SVM,权重 0.4:0.4:0.2)。在测试集上,RF、SVM、CNN 的 AUC 分别为 0.94、0.92、0.92,集成模型 AUC 达 0.94,优于任一单模型。将该模型应用于 COCONUT 天然产物数据库筛选后,输出预测抑制概率最高的前 5 个候选分子,葛根素位列第 4。

图2. 集成深度学习虚拟筛选流程及模型性能评估


3. 葛根素改善 MCAO 大鼠神经功能并减轻脑损伤

为了评估葛根素在缺血性脑卒中中的治疗潜力,我们在MCAO再灌注大鼠模型中评估了不同剂量葛根素给药的效果(图3A)。MCAO 大鼠按 50、100、200 mg/kg(Pue-L/M/H)灌胃给药 7 天。mNSS 评分显示,I/R 组神经功能缺损严重,三个剂量组评分随给药时间与剂量增加而下降;TTC 染色显示 I/R 组梗死灶明显,葛根素可缩小梗死体积。组织学上,H&E 显示 I/R 海马 CA1 区神经元排列紊乱、核固缩、空泡化(Pue-H 改善最明显),Nissl 与 TUNEL 分别显示神经元丢失与凋亡增多,葛根素均减轻。Western blot 显示 I/R 上调 Bax 与 Cleaved Caspase-3、下调 Bcl-2,葛根素逆转该失衡。


图3. 葛根素改善 MCAO 大鼠神经功能、减轻脑损伤并逆转凋亡相关蛋白表达、


4. 磷酸化修饰蛋白质组学揭示葛根素通过抑制 CaMKIIδ 及其下游突触蛋白的磷酸化来发挥作用

为了阐明葛根素的神经保护作用的分子机制,研究团队进一步比较了模型组与葛根素处理组(Pue)的蛋白质组学和磷酸化修饰蛋白质组学结果。PCA 结果显示葛根素显著改变了海马的蛋白质与磷酸化修饰谱;火山图显示磷酸化位点在 Pue 组广泛下调,提示其主要抑制激酶活性。GO/KEGG 富集分析显示,葛根素调控的差异磷酸化蛋白同样富集于突触密度、谷氨酸能突触与钙信号通路。针对 CaMKIIδ 的富集分析表明,其底物在模型组磷酸化水平升高、Pue 组被显著逆转,且 Thr287 磷酸化水平明显降低;PPI 蛋白互作网络分析显示 CaMKIIδ 与 DLG4(PSD-95)直接互作。上述结果提示葛根素通过调控 DLG4 磷酸化影响突触稳定性。


图4. 磷酸化修饰蛋白质组学揭示葛根素显著改变 I/R 大鼠海马磷酸化修饰谱,并抑制 CaMKIIδ 及其下游突触蛋白磷酸化


5. 葛根素阻断 CaMKIIδ 介导的 DLG4 磷酸化、恢复 DLG4–GluR1 相互作用

为验证葛根素对 CaMKIIδ–DLG4 轴(DLG4/PSD-95 作为突触后 AMPA 受体支架)的直接作用,研究团队在体内外检测了 CaMKIIδ 活化状态与 DLG4 磷酸化水平,并考察 DLG4 与 GluR1 的相互作用。Western blot 结果显示,I/R 显著升高 p-CaMKIIδ-Thr287 磷酸化水平,葛根素呈剂量依赖地抑制该位点磷酸化;免疫荧光结果显示,活化的 p-CaMKIIδ 定位于神经元(NeuN+),并与 DLG4 紧密共定位。Co-IP 实验显示,I/R 升高了 DLG4 的丝氨酸磷酸化水平,葛根素可逆转这一变化;与 DLG4 共沉淀的 GluR1 在 I/R 组明显减少(提示复合体解离),葛根素可恢复二者结合,而对 GluR2 无明显影响。上述结果提示,葛根素通过抑制 CaMKIIδ 活化、阻断 DLG4 异常磷酸化及 DLG4–GluR1 解离,从而挽救缺血诱导的 AMPA 受体丢失。


图5. 葛根素阻断 CaMKIIδ 介导的 DLG4 磷酸化并恢复 DLG4–GluR1 相互作用


6. 分子模拟、SPR 与体外激酶实验证实葛根素直接结合并抑制 CaMKIIδ

为阐明葛根素与 CaMKIIδ 的直接结合关系,研究团队开展了分子模拟、SPR 与体外激酶实验。HPLC 分析表明,在病理状态下葛根素可入血并分布至脑组织。分子模拟结果显示,Gly21 为关键结合热点,G21A 突变会显著改变结合模式;分子动力学模拟显示,葛根素与野生型(WT)CaMKIIδ 的结合较 G21A 突变体更稳定、氢键更多且更持久;MM-PBSA 结合自由能计算显示,WT 结合自由能为 −128.237 kJ/mol、G21A 为 −105.478 kJ/mol。SPR 实验证实,葛根素以浓度依赖的方式直接、可逆地结合重组 CaMKIIδ,解离常数 KD = 1.79 μM(ka = 9.25×10³ M⁻¹s⁻¹,kd = 1.66×10⁻² s⁻¹)。体外激酶实验(以 UPLC-MS/MS 监测 AC-2 消耗)进一步证实葛根素抑制 CaMKIIδ 激酶活性。上述结果提示,葛根素可直接结合并抑制 CaMKIIδ 激酶活性。


图6. 葛根素可入血并分布至脑组织,分子模拟与 SPR 证实其直接结合 CaMKIIδ ATP 口袋


7. 计算预测与体外重构 LC-MS/MS 首次证实 Ser654 为 CaMKIIδ 直接磷酸化 DLG4 新位点

为确定 CaMKIIδ 直接磷酸化 DLG4 的具体位点,研究团队以 GPS 6.0 预测得分最高的 Ser654 为重点开展了体外重构验证。将重组 DLG4(3 μg)与 CaMKIIδ(100 nM)共孵育,在 ATP 驱动下反应 90 min 后,以 LC-MS/MS(timsTOF)分析,结果证实 CaMKIIδ 可直接磷酸化 DLG4 的 Ser654;100 μM 葛根素可抑制该磷酸化事件。这是首次以生化手段证明 Ser654 是 CaMKIIδ 直接磷酸化 DLG4 的新位点;病理性 DLG4-Ser654 磷酸化与 AMPA 受体(GluR1/2)解离及线粒体依赖性神经元凋亡密切相关。


图7. GPS 6.0 预测与体外重构 LC-MS/MS 确证 Ser654 为 CaMKIIδ 直接磷酸化 DLG4 的新位点


8. 体内外封阻实验确认 CaMKIIδ 抑制是核心机制

为在整体水平确认 CaMKIIδ 抑制是葛根素的核心作用机制,研究团队开展了体内外封阻(occlusion)实验。封阻实验显示,在 MCAO 大鼠与 PC-12 NMDA 模型中,葛根素与 CaMKIIδ 抑制剂 KN-93 联用未产生叠加保护(效应相互封阻),提示二者作用于同一通路;以 siRNA 敲低 CaMKIIδ 可复制葛根素的保护表型,且联用无叠加效应。在 PC-12 模型中,葛根素抑制 CaMKIIδ 活化、阻断 DLG4-Ser654 磷酸化、恢复 DLG4–GluR1 相互作用并减轻神经毒性损伤。上述结果确证,特异性抑制 CaMKIIδ 是葛根素减轻脑 I/R 损伤的核心机制。


图8. PC-12 NMDA 兴奋性毒性模型中葛根素与 KN-93 相互封阻,提示二者作用于同一通路


图9. siRNA 敲低 CaMKIIδ 可复制葛根素的保护表型,且与葛根素联用无叠加效应

图10. MCAO 大鼠中 KN-93 与葛根素联用未产生叠加保护,进一步验证 CaMKIIδ 为核心靶点



 研 究 意 义 


本研究整合蛋白质组学、磷酸化修饰蛋白质组学深度学习虚拟筛选、分子动力学模拟与体内外验证,首次揭示 CaMKIIδ–DLG4–AMPAR 病理级联,并阐明葛根素的作用机制其科学意义主要体现在三方面:

① 借助磷酸化蛋白质组与 KSEA,将 CaMKIIδ(而非 CaMKII 家族整体)经 Thr287 自磷酸化特异性活化锁定为 I/R 损伤海马的关键驱动,突破了既往将 CaMKII 视为单一整体的认知;

② 通过体外重构激酶体系联合 LC-MS/MS,首次以生化手段确证 DLG4 的 Ser654 是 CaMKIIδ 直接磷酸化的新位点,从而解释了 DLG4–AMPA 受体解离这一突触失效的核心环节;

③ 首次证实葛根素是 CaMKIIδ 的新型直接抑制剂,可锚定其 ATP 结合口袋抑制激酶活性(KD = 1.79 μM)。

该研究不仅改写了对 CaMKII 家族亚型功能的传统理解(δ 亚型既往被认为主要定位于心脏等非神经组织),也为缺血性脑卒中的精准干预提供了新靶点与候选药物。

图11. CaMKIIδ–DLG4–AMPAR 病理级联及葛根素干预机制示意图



上一页:Microbiome | 天津医科大学张涛团队发表上消化道癌队列研究成果下一页:没有了