2024年8月-客户文章合集
多年来,欧易生物深耕于生命科学科研服务行业,致力于为生命科学领域的科学家和研发人员提供靠谱的创新多组学技术服务。欧易生物在单细胞与空间多组学、传统转录组学、基因组学、蛋白代谢组学及微生物组学等方向积累了深厚经验,打造了成熟的多组学一站式服务平台。迄今为止,我们以“硬数据,好服务”的理念,助力客户在高端国际期刊上发表了大量文章。
喜 报
据不完全统计,2024年8月欧易生物已助力125篇客户文章发表在各领域知名期刊上,累计IF高达895.4分,平均IF达到7.1分。其中包括European Heart Journal,Advanced Materials,Advanced Functional Materials,ACS Nano 等在内的10分以上文章25篇。此次收录的文章涵盖多个研究方向,如涉及单细胞时空组学方向10篇、转录调控方向67篇、基因组方向5篇、表观方向1篇、微生物方向13篇、酵母文库 4篇、蛋白组&代谢组6篇、云平台14篇、多组学联合5篇。
接下来让我们一起回顾一下最新的科研成果!
文章精选
European Heart Journal | 血管性血友病因子通过形成中性粒细胞胞外陷阱加剧心力衰竭
影响因子:37.6
作者单位:哈尔滨医科大学附属第二医院
涉及的欧易生物服务产品:转录组测序
研究内容:心力衰竭(HF)是全球范围内导致死亡的主要原因,其特点是合并症严重且预后不良。中性粒细胞胞外陷阱(NET)会加剧各种心血管疾病中的炎症;然而,它们在HF发病机制中的作用和作用机制仍未得到充分探索。该研究检查了HF患者和小鼠主动脉缩窄(TAC)HF模型中的NET水平。使用PAD4敲除小鼠和NET抑制剂(GSK-484、DNase I、NEi)评估NET在HF中的作用。使用RNA测序研究下游机制。使用重组的人ADAMTS13 (rhADAMTS13)、ADAMTS13和SLC44A2敲除来识别NET的新上游因子。在HF患者和TAC小鼠HF模型中观察到NET水平升高。PAD4敲除和NET抑制剂改善了心脏功能。从机制上讲,NET诱导心肌细胞线粒体功能障碍,通过NE-TLR4介导的PGC-1α抑制来抑制线粒体的生物合成。此外,VWF/ADAMTS13通过SLC44A2调节NET的形成,沙库巴曲/缬沙坦增强了VWF-SLC44A2-NET轴阻断的心脏保护作用。该研究确定了新型VWF-SLC44A2-NET轴在调节线粒体稳态和功能、导致心脏细胞凋亡和HF发病机制中的作用。
文章精选
Advanced Materials | 基于昼夜节律调控的脂肪干细胞源性小胞外囊泡(sEVs)及三阶段微针递送系统以增强肌腱-骨愈合
影响因子:27.4
作者单位:上海交通大学附属第六人民医院
涉及的欧易生物服务产品:转录组测序
研究内容:在修复肩袖撕裂(RCR)的过程中,调节炎症微环境以重建纤维软骨层并促进肌腱修复对于增强肌腱与骨的愈合至关重要,这是骨科领域长期存在的挑战。小细胞外囊泡(sEVs)在调节炎症方面具有显著潜力,但高效生产高生物活性的sEVs仍是其临床应用的重大障碍。此外,实现sEVs在肌腱与骨界面处的微创局部递送也面临重大技术难题。该研究通过调节脂肪干细胞的昼夜节律来增加sEVs的产量并增强其炎症调节能力。昼夜节律调节的sEVs(CR-sEVs)通过递送血小板因子4(PF4),增强巨噬细胞(Mφ)中的环磷酸腺苷(cAMP)信号通路,从而抑制Mφ向M1极化。随后设计了一种具有尖端、茎干和基底的三相微针(MN)支架,用于在肌腱与骨交界处局部递送CR-sEVs(CR-sEVs/MN),并在基底中整合肌腱来源的去细胞细胞外基质以促进肌腱修复。在大鼠RCR模型中,CR-sEVs/MN可减轻炎症、促进纤维软骨再生并增强肌腱愈合,从而改善生物力学强度和肩关节功能。将CR-sEVs与这种三相微针递送系统相结合,为临床环境中增强肌腱与骨愈合提供了一种有前景的策略。
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Advanced Materials | 六氰基铁酸钙(III)纳米催化剂可实现氧化还原稳态,用于治疗自闭症谱系障碍
影响因子:27.4
作者单位:上海大学
涉及的欧易生物服务产品:单细胞转录组测序
研究内容:自闭症谱系障碍(ASD)是一种具有显著异质性的多面性神经发育障碍,其中过量产生的活性氧(ROS)会引发一系列病理变化,包括细胞凋亡和炎症反应。鉴于ASD复杂的病因,目前尚无有效的治疗方法。本研究设计并开发了一种特定的催化纳米酶——氰铁酸钙(III)纳米催化剂(CaH NCs),用于有效治疗ASD。CaH NCs能够模拟包括超氧化物歧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶和谷胱甘肽过氧化物酶在内的天然酶的活性,从而减轻细胞内过量的ROS并调节氧化还原平衡。这些CaH NCs调节线粒体膜电位,提高B细胞淋巴瘤-2水平,并抑制包括Caspase-3和B细胞淋巴瘤-2相关X蛋白在内的促凋亡蛋白,从而有效减少细胞凋亡。重要的是,CaH NCs通过上调抗炎细胞因子白介素-10和下调促炎因子,减轻炎症,进而减弱小胶质细胞和星形胶质细胞的激活,并减少神经炎症。随后,CaH NCs通过调节炎症和抑制凋亡,在ASD动物模型中增强社交能力、降低焦虑水平、改善重复行为以及提高学习和记忆能力。CaH NCs在管理和预防ASD方面的应用代表了自闭症治疗领域的一个范式转变,为神经疾病的临床干预开辟了一条有效的途径。
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Advanced Functional Materials | 具有顺序抗菌和成骨功能的同轴 3D 打印支架可有效修复感染的下颌骨缺损
影响因子:18.5
作者单位:四川大学华西口腔医院
涉及的欧易生物服务产品:转录组测序
研究内容:该研究开发了一种同轴3D打印支架,其外壳负载有盐酸米诺环素,核心包裹有中药鹿角粉。体外研究表明,该支架具有多孔微结构、优异的力学性能、适当的降解性、可接受的吸水能力和良好的生物相容性。转录组分析进一步揭示了与细胞活性、成骨和血管生成相关的基因和信号通路显著上调。体内大鼠(直径5mm)和兔子(5mm×4mm×10mm)下颌骨缺损模型证实,该支架能够通过抑制感染和炎症,随后促进成骨和血管生成,来顺序调节骨愈合。
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Advanced Functional Materials | 富含氧空位介导压电性的异质结构压电纳米棒可用于超声触发的压电催化癌症治疗
影响因子:18.5
作者单位:苏州市立医院
涉及的欧易生物服务产品:转录组测序
研究内容:在超声(US)触发的肿瘤治疗中,利用压电生物纳米材料促进活性氧(ROS)的生成正受到越来越多的关注。这种创新治疗方法的机制涉及超声辐射,它激活压电材料(PEM)中的内置电场(BIEF)并引起能带弯曲。该研究采用熔盐法合成了Sr0.5Ba0.5Nb2O6(SBN)纳米棒(NRs)。随后,通过对SBN NRs进行氢气退火处理,制备了富含氧空位(OV)的SBN/Sr2Nb2O7(SBN/SNO)异质结纳米复合材料(NCs)。该工程策略侧重于增强ROS的生成,从而增强NCs的压电催化活性。这种配置确保了BIEF和异质结诱导的电场协同作用,为电子-空穴(e--h+)对的分离提供了持续的驱动力。重要的是,氢气退火后的SBN NRs表面上的OV形成了富电子位点,显著增强了其压电催化能力。对肝细胞癌(HCC)模型的体内外分析表明,这种富含OV介导的声压电疗法(SPT)具有显著的细胞毒性和肿瘤抑制作用,并展示了其作为癌症治疗有前景的治疗方法的潜力。
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Advanced Functional Materials | 基于水凝胶缓解口腔菌群失调和细菌引发的促炎免疫反应来控制牙槽骨丧失
影响因子:18.5
作者单位:四川大学华西口腔医院
涉及的欧易生物服务产品:微生物多样性测序
研究内容:牙周炎是一种慢性疾病,异常的宿主-微生物群相互作用会改变口腔微生物群,引发促炎性免疫反应,并导致炎性牙槽骨丢失。虽然抗生素有时是治疗牙周炎的必要条件,但其使用必须谨慎管理,以防止产生耐药性和口腔菌群失调。
因此,开发新的牙周炎治疗策略至关重要,这些策略应在减少抗生素依赖的同时有效控制细菌引发的炎症。在该研究中,通过将阳离子聚酰胺-胺型树枝状聚合物(PAMAM-G3)嫁接到氧化羧甲基纤维素(OCMC)骨架上,设计了一种可注射的阳离子水凝胶(OCMC-PAMAM-G3,简称O-P)。这种水凝胶能够捕获阴离子微生物相关分子模式(MAMPs),如脂多糖(LPS)和游离DNA(cfDNA)。这些发现表明,使用O-P水凝胶可绕过传统抗生素对口腔粘膜微生物组的破坏。同时,这种水凝胶可以通过缓解 LPS/cfDNA-TLR4/9 通路来减轻结扎诱发的牙周炎小鼠模型中的炎症性牙槽骨丢失。此外,局部使用O-P水凝胶对口腔粘膜微生物组无显著不良影响,同时改善了局部龈下微生物群。该研究强调了一种针对MAMPs的策略,同时避免了抗生素的使用,因为它可以减轻细菌引发的促炎免疫反应,并可能保持口腔菌群失调的平衡。
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ACS Nano | 姜黄素重构纳米囊泡的研制及其在多方面肥胖干预中的评估
影响因子:15.8
作者单位:集美大学
涉及的欧易生物服务产品:微生物多样性测序
研究内容:肥胖症的患病率不断上升,给人们带来了巨大的健康挑战。大多数现有药物,如食欲抑制剂和脂肪吸收抑制剂,疗效有限,副作用大。受姜黄多种代谢作用的启发,该研究开发了一种天然纳米制剂“重建姜黄衍生纳米囊泡 (Rec-tNVs)”,用于治疗肥胖症。通过定量纳米流式细胞术,该研究发现单个Rec-tNVs中的姜黄素含量相比其超速离心分离的对应物增加了四个数量级(每个粒子约108个分子)。Rec-tNV具有高度聚集的姜黄素排列和其他共封装的生物活性化合物,通过促进脂肪分解、抑制脂肪生成、诱导脂肪细胞褐变和通过多种途径内化后触发细胞凋亡,在成熟的3T3-L1细胞中表现出剂量依赖性的降脂作用。体内实验表明,Rec-tNVs比游离姜黄素更有效地缓解肥胖,在高脂饮食小鼠模型中,通过胃内和皮下给药,在四周治疗期内体重分别减轻了18.68%和14.56%。这些效果归因于对脂肪组织的针对性作用以及对代谢和肠道微生物群组成的系统性影响。总体而言,这项研究强调了Rec-tNVs多方面的抗肥胖功效,并为开发基于植物的纳米囊泡疗法提供了一个有希望的范例。
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Advanced Science | 冬凌草乙素通过稳定Keap1-PGAM5复合物促进肝细胞癌线粒体凋亡
影响因子:14.3
作者单位:广东中医药大学
涉及的欧易生物服务产品:蛋白质谱鉴定
研究内容:冬凌草乙素是一种二萜化合物,在临床试验中被证实具有抗肿瘤活性。然而,它对肝细胞癌(HCC)的具体功能和作用机制仍不清楚。通过使用生物素标记的冬凌草乙素进行靶标捕获和HuProtTM人类蛋白质组微阵列V4.0,研究表明冬凌草乙素靶向Keap1并促进Keap1-PGAM5复合物的形成,从而导致PGAM5的泛素化。冬凌草乙素通过PGAM5激活半胱氨酸依赖性线粒体途径,导致线粒体损伤和ROS产生,从而促进HepG2细胞线粒体凋亡。该研究首次获得了PGAM5 IE 12肽段与Keap1 Kelch结构域的体外共结晶结构。通过分子动力学模拟证实了冬凌草乙素与Keap1-PGAM5复合物的结合。基于深度动力学模拟发现冬凌草乙素可以诱导Keap1-PGAM5相互作用口袋的收紧,从而稳定蛋白复合物的形成。最后,在BALB/c裸鼠异种移植瘤模型中观察到冬凌草乙素有效抑制肿瘤生长并促进肿瘤细胞凋亡。这些结果为基于Keap1-PGAM5复合物机制的冬凌草乙素抗HCC特性提供了见解。
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Advanced Science | 甲型流感病毒的血凝素诱导铁死亡以促进病毒复制
影响因子:14.3
作者单位:华中农业大学
涉及的欧易生物服务产品:云平台
研究内容:铁死亡是一种新型的细胞死亡形式,由铁依赖性脂质过氧化物的积累引起。然而,甲型流感病毒(IAV)利用铁死亡的确切机制仍不清楚。该研究表明,IAV通过铁蛋白吞噬作用促进自身复制,使细胞对铁死亡敏感,血凝素为这一过程中的关键触发因素。血凝素与自噬受体核受体辅激活因子4 (NCOA4)和tax1结合蛋白1 (TAX1BP1)相互作用,促进铁蛋白-NCOA4凝聚物的形成并诱导铁蛋白吞噬。进一步研究表明,血凝素诱导的铁蛋白吞噬作用导致细胞脂质过氧化,抑制线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)的聚集,并抑制I型干扰素反应,从而促进病毒复制。总的来说,该研究揭示了一种新的机制,即IAV血凝素诱导铁蛋白吞噬导致细胞脂质过氧化,从而削弱MAVS介导的抗病毒免疫。
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Advanced Science | Sirtuin 5 介导的 ALDH2 去琥珀酰化可减轻对乙酰氨基酚诱发的急性肝损伤后的线粒体氧化应激
影响因子:14.3
作者单位:郑州大学第一附属医院
涉及的欧易生物服务产品:转录组测序
研究内容:Sirtiun 5(SIRT5)是一种NAD+依赖性的蛋白质赖氨酸脱酰基酶,对乙酰氨基酚(APAP)过量是药物性肝损伤的主要原因。Sirtuins 5 (SIRT5)与各种肝脏疾病的发展有关。然而,其与APAP诱发的急性肝损伤(AILI)的关系仍不清楚。该研究显示,APAP给药后小鼠肝脏和AML12肝细胞中的SIRT5表达显著下调。SIRT5缺乏不仅会加剧肝损伤和炎症反应,还会加剧线粒体的氧化应激。相反,在SIRT5过表达的小鼠中观察到相反的病理和生化变化。机制上,定量琥珀酰组学分析和位点突变实验表明,SIRT5在赖氨酸385位点对醛脱氢酶2 (ALDH2)进行去琥珀酰化,并保持ALDH2的酶活性,从而抑制炎症和线粒体氧化应激。此外,ALDH2在赖氨酸385位点的琥珀酰化消除了其对AILI的保护作用,而SIRT5对AILI的保护作用依赖于ALDH2在K385位点的去琥珀酰化。最后,天然化合物的虚拟筛选表明,葛根素可促进SIRT5去琥珀酰酶活性并进一步减弱AILI。总之,该研究表明SIRT5-ALDH2在AILI进展中起着关键作用,可能是一种治疗干预策略。