空间代谢组可以解决什么问题？

空间代谢组解决的核心问题:简单来讲，就是解决小分子代谢物在切片上的空间分布。

我们都知道，组织是有异质性的，一张切片往往具有多个病理区域，通过常规代谢组将组织匀浆后获得代谢物，是无法获得代谢物的空间分布。如果通过人工切割的方式，往往难以将一些病理区域边界复杂的区域干净地做区分，并且对于常规组学都有一定的样本量要求。比如做LC-MS全谱代谢组需要的单个样本量常规需要50mg，那么将切割下来的微区混样够过常规组学，也是有一定的挑战。但是通过空间代谢组，一次性就可以检测到一张切片成百上千的物质，获得这些小分子物质的定性、定量和空间定位信息，能够非常直观看到，一个代谢物在整个组织切片上的变化趋势。并且对于一些很微小的区域，也是可以观测到区域中的代谢物分布变化。这样可以充分将代谢物的所执行的功能与切片微区的病理结构充分进行结合阐述。

空间代谢组能做到的分辨率是多少？

空间代谢组目前常规在做的空间分辨率是20um*20um、50um*50um、100um*100um。空间代谢组是连续采集切片上的每个点中的小分子物质进行检测，因此空间分辨率的大小指的就是一个采集点的大小。我们要选择自己合适的分辨率来做，而不是盲目追求高分辨率。

一般会综合考虑几个点来选择分辨率：

第一点是自己关注的微区大小，在选择的分辨率下去检测，是否有足够的像素点数据。可以通过一个粗糙的算法去计算自己关注的微区可以获得多少个像素点，公式：微区的面积大小除以选择的空间分辨率。

第二点就是包含了自己所有关注病理区域的切片大小，分辨率越高能够检测的样本面积越小，因此如果自己的样本比较大，而自己关注的病理区域通过100um*100um可以获得足够的像素点数据，那么100um*100um已经是一个合适的分辨率选择。

第三点就是经费考虑，分辨率越高面积越大，检测的费用也会更高。

因此我们要综合去考量选择什么分辨率来做自己的项目。

哪些样本适合做空间代谢组？

针对动物样本：新鲜动物样本、冰冻样本都可以做空间代谢组，新鲜动物样本为优。

针对植物样本：由于植物样本中水分较多，空间代谢组做的是冰冻切片，因此对于植物样本，需要寄送新鲜植物。

针对中药样本：建议新鲜样本，若是干燥的中药饮片我们也有办法去解决。

空间代谢组一张切片的厚度是多少？

空间代谢组做的是冰冻切片，一张切片的厚度一般是10um，针对一些空洞较多的样本或者植物样本，会适当加厚切片的厚度。

空间代谢组是否也像常规代谢组按照正负离子进行采集？

空间代谢组和常规代谢组都是基于质谱进行检测，而质谱是检测带电荷的物质。但是不同物质的理化性质不同，结构基团也不同，就会造成有的物质容易带正电荷，有的物质容易带负电荷。比如碱性化合物容易带正电荷，酸性化合物容易带负电荷。因此若想尽可能全面地去检测切片上有哪些代谢物，最好的方式就是正离子模式和负离子模式两个模式都去检测。

你们公司究竟有多少实力来保证项目的顺利开展？

欧易生物质谱从2021年开始对外正式推出，承接中国医学科学院的贺玖明教授在DESI的仪器研发及应用的10年经验，并且在2023年引入Waters Snapt XS 的DESI质谱成像仪，现在一共有3套质谱成像平台，成为国内DESI体系平台最全面的公司。

截止到2023年12月，已经交付的项目数有400+,样本数量3000+。从取样、切片、上机、分析、售后服务积累了大量可以落地的经验，尤其是在切片和售后服务上。其中片子切的质量好坏，直接影响上机的质量，这块技能完全是需要靠着大量的项目积累出来，而售后服务的经验也同样是靠着大量的项目经验积累起来，做到更有效地支持客户对空代数据的挖掘加速文章成果的落地。

欧易生物质谱一直在打造靠谱的空间代谢组，靠谱包括数据质量、售后服务、多组学一体化解决方案。